目前对本病缺乏特异的疗法，治疗方法不少，而疗效不高，一般以综合疗法较好。据收集资料参考，对断奶仔猪水肿病可采取以下疗法：1、链霉素1g，一日一次或两次注射，或链霉素0.5g，文生素B12。200mg，肌肉注射连续2日，有较好效果。2、20%甘露醇20-50毫升或25%山梨醇30-50毫升，加庆大霉素8-16万单位，文生素C2支，静脉缓慢注射，一日一次，连用2日，效果较理想。3、作为辅助治疗可用辅酶A2支肌肉注射，一日一次，两次缓解病情。4、庆福0.3ml/kg体重肌注或消肿王0.2ml/kg体重肌注，或强力水肿消注射液，每公斤体重0.5ml，肌注，每天2次，连用2-3天。另外每头猪肌注亚硒酸钠文生素E针3-4ml/头，一次即可。同时内服纯土霉素碱，按每公斤体重40mg计算，每日一次，连服5日，效果更好。5、10％安那咖注射液2-4ml1次皮下注射，视情况第2天再注射1次。
中药治疗：茯苓、白术、厚朴、青皮、生姜各20克，陈皮、大枣各30克，泽泻、甘草各15克，乌梅3个。用于15千克重仔猪，煮水分2次内服；茯苓皮、牵牛子、木通各15克，石斛、苍术各20克，大腹皮、朱苓、陈皮、红花各10，煮水后加雄黄粉30克，分2次内服；大腹皮、陈皮、茯苓皮、桑白皮、生姜皮各20克，淡豆豉、香菇、杏仁、紫苏、车前草各15克，厚朴、通草各10克，煮水服，少则1剂、多则3剂可愈；麻黄、白术、陈皮、白芍、木通、附片各20克，知母、泽泻、茯苓、车前子、麦芽各15克，细辛5克，桂枝、生姜各10，煮水服，少则1剂，多则3剂可愈。
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本病的预防主要是加强断奶前后仔猪的饲养管理。仔猪出生后7～10日补料，从断奶到喂全价料要稳步过渡。仔猪在吃饲料期间，每隔5～7天口服敌菌净2～4片。对发病猪群减少或停喂高蛋白饲料。缺硒的应注意补硒和文生素E。免疫预防，用辽宁省益康生物制品厂生产的仔猪水肿病三价灭活疫苗对14～18日龄仔猪进行免疫，每头肌注2毫升。在已发生仔猪黄痢的猪群，仔猪出生后立即口服或肌注抗血清，可获满意预防效果。仔猪要提早补饲，训练采食，使断乳后能较快适应独立生活。断奶不要太突然。断乳仔猪给以营养丰富又易消化的青绿饲料，多样化，避免单纯饲喂浓缩精料。避免突然改换饲料。圈舍要干燥清洁。发病后，要马上消除致病诱因，停喂浓缩精料。病猪及时治疗。