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油菜核盘菌的分离鉴定及侵染分析 第3页

更新时间:2016-9-11:  来源:毕业论文
.1 供试材料
    用于侵染实验所用的菌种是由从感染油菜中分离纯化好的核盘菌,被侵染植物为实验室种植的番茄和拟南芥。
1.2 供试培养基
马铃薯培养基(PDA):马铃薯200g,葡萄糖20g,琼脂16g。马铃薯洗净去皮,切成小块,放入1000ml水中煮沸30min,用4层纱布过滤,加入琼脂和葡萄糖,搅拌至溶解后补足水分至1000ml,分装、包扎,灭菌。
1.3 供试试剂
75%的酒精,0.1%的升汞,蒸馏水,2%CTAB抽提缓冲液,2-巯基乙醇,氯仿,异戊醇,无水乙醇,TE缓冲液,DAB,台盼蓝染色试剂,固定液,水合三氯乙醛等。
2.实验方法
2.1 核盘菌的显微形态分析
将分离后的菌种放入PDA培养基中心,在25℃培养箱中分离纯化培养[4-5],对PDA固体培养基平板和显微镜下不同时期的菌落和菌丝颜色、形状和大小进行观察,拍照并纪录。
2.2 核盘菌ITS序列分析
2.2.1 核盘菌DNA的提取
本实验采取CTAB法提取DNA[6]。
在PDA平板培养基上刮取100g菌丝,在灭菌研钵中加入液氮充分研磨至粉末状,再加入3ml预热的2%的CTAB抽提缓冲液和50µL的2-巯基乙醇,继续研磨至糊状或粥状,转入离心管中,于65℃水浴加热60min,待冷却至室温后加入600µL氯仿/异戊醇(氯仿:异戊醇=24:1),混匀震荡再常温10000rpm离心10 min,取上清液转入另一离心管,在此离心管中再加入600µL,再离心震荡取上清液,在上清液加入2.5倍体积无水乙醇,-20℃冷冻30min以上沉淀DNA,在4℃,12000rmp离心10min,弃去上层有机溶剂,加500µL75%乙醇洗涤沉淀,在4℃,8000rmp离心5min,弃去上清,洗涤沉淀3次后倒置37℃培养箱烘干,加50µLTE缓冲液溶解DNA,于-20℃冷藏备用。
2.2.2 PCR的扩增和检测
本实验扩增ITS片段用引物ITS1、ITS4[7]: ITS1:5’TCCGTAGGTGAACCTGCGG3’,ITS4:5’TCCTCCGCTTATTGATATGC3’;扩增采用20µL反应体系;各组分为:灭菌去离子水9µL,Buffer2µL,dNTP2µL,引物ITS1和ITS4各1.5µL,TaqDNA聚合酶2µL,DNA模板2µL。扩增程序:94℃变性5mim;94℃变性30s,48℃退火45s,72℃延伸1mim,35个循环;72℃延伸5min。PCR扩增产物测序后与GenBank中核酸数据库中已知种的DNA序列比,构建系统进化树来推演系统发生关系。

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