1.3.2 rDNA–ITS区扩增及产物检测
实验使用的引物是真菌核糖体ITS区段的通用引物ITS1和ITS4,由北京奥科生物技术公司合成。ITS1序列是:5’-TCCGTAGCTGAACCTGCGG-3’;ITS4序列是:5’-TCCTCCGCTTATTGATATGC-3’。PCR反应体系为:灭菌去离子水 9.75µL,Buffer 2µL,dNTP 2µL,引物ITS1 2µL,引物ITS4 2µL,Taq DNA聚合酶 0.25µL,DNA模板2µL。PCR反应条件:94℃ 5min,94℃ 30S,48℃ 30S,72℃ 1min,共30个循环,最后一个循环在72℃继续延伸10min,扩增产物在4℃保存。
1.3.3 PCR产物的回收、克隆与测序
取3µL扩增产物在1%的琼脂糖凝胶上进行电泳,然后进行EB染色,之后,用凝胶成像系统检测其扩增结果,将得到的PCR产物用DNA纯化试剂盒纯化后,送至北京奥科生物技术公司进行测序。
1.3.4 rDNA-ITS序列分析
在GenBank核酸序列数据库中搜索并下载同源性高的ITS序列(含5.8S)区,选取不同地区的Oidium neolycopersici、Oidium lycopersici、Oidiumhortensiae和Erysiphe的ITS序列进行比对,用MEGA3.1构建系统进化树,分析其遗传进化关系,经bootstrap法,1000次循环检验系统树的可靠性。
2.结果与分析
2.1病原菌形态特征
番茄白粉病菌主要感染于番茄幼嫩叶片和新梢部位,发病初期可以看见有散状的白色小圆斑分布在叶片上,在叶片上的病斑随着感染的时间的增加会慢慢扩大到整个叶片表面,使叶片表面布有很厚的一层粉层,且病斑的边缘是呈放射状的,整个叶片随着病情的不断加重会逐步出现黄萎、皱缩、卷曲、凋谢,如图1。另外,在进行白粉层的擦拭时,可见病斑的形状,一般呈圆形或无规则形。白粉病菌作为一种非常严格的植物寄生菌,在人工培养的培养基上,一般很难生长,所以可通过SEM电子扫描来观察其形态特征,如图2-3,扫描的病菌平均长度是31.2µm,宽度是14.1µm,分生孢子梗,直立、不分枝且中间有隔膜,平均长度是59.4µm,宽度是5.3µm,从植物感染病症和孢子形态结构上进行分析可初步认定该病菌为白粉病菌。
图1蕃茄白粉病的初期症状 图2番茄白粉菌孢子梗扫描电子显微结构
图3番茄白粉菌孢S区的扩增和测序
2.2 ITS区的扩增和测序
用毛刷轻轻刷取感染叶片上的白粉病菌置于无菌水中,研磨破碎病菌细胞,利用改良的CTAB法提取白粉菌的DNA,采用真菌核糖体ITS区通用的引物ITS1和ITS4,对rDNA基因区ITS片段进行PCR反应,经过30个循环可得到大概600bp的目的片段本文来自辣-文^论~文/网,
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