网络审计在我国的发展时间还不算长，虽然也取得了一定的成果，但是伴随着网络审计的进一步发展，越来越多的问题也出现在了我们的面前，严重制约了我国网络审计的普及和发展，其主要问题表现在以下几个方面：
（一）网络审计理论研究不足
在我国，网络在企业管理中的推广应用才刚刚开始，较大型的系统还不多。人们对网络财务及其网络审计的认识还较模糊，网络审计理论研究尚处于初级阶段。从发表在各种专业杂志上的有关网络审计方面的论文看，涉及网络审计理论研究的文章并不多，而市场上相关的各种审计软件不断出现，网络审计的理论研究和实践出现了不平衡的局面，网络审计软件将会因为缺乏理论的指导，重复会计软件开发初期时的老路，误入歧途，多走弯路。论文网http://www.751com.cn/
（二）财务网络体系及审计部门网络化建设发展不平衡
财务网络体系的建立及审计部门网络化, 是实现网络审计模式的最基本条件。目前, 政府、企业的网络建设在地区之间、层级之间、行业之间存在较大差异, 网络信息化领先和后进地方的差距日益拉大, 网络信息化建设的阶段与地域发展不平衡, 因此, 各地财务网络体系发展不平衡。各地审计部门的网络化建设发展同样不平衡, 部分地方审计机关由于客观环境、人员技术等原因制约审计网络系统建设发展, 在一些行业审计领域受到审计对象信息化程度不高、自身思想认识不足等主客观方面的影响, 至今仍停留在手工审计阶段。
（三）网络审计的相关法律和审计准则不完善
在网络时代，社会的信息化加大了社会的不确定性，而法律对规范社会经济的运作、控制社会经济秩序具有不可替代的作用，尤其在网络经济环境下，法律的重要性更为突出。网络审计作为一个文护社会经济秩序并服务于经济领域的中介活动，迫切需要一套符合自身发展规律的法律来规范，建立起一套能规范网络审计的审计准则，作为文护经济秩序的法律屏障。本文来自辣.文~论^文·网原文请找腾讯3249.114
美、日、英等国都制定了有关计算机审计的审计准则。国际审计准则中，对此也有专门计算机审计的范围、目标、程序、技术及方法。我国的《中国注册会计师独立审计准则》中也有涉及到计算机辅助审计的内容，但针对网络经济时代下日益发展的电子商务系统及随之而出现的一系列新的问题，旧有的审计标准准则体系和法律法规体系已不能完全适应、指导和规范网络经济时代的审计实践。网络本身的虚拟性、实时性、广泛性要求比传统审计更加切实可行、更加完备的标准准则和法律法规的保证。
（四）网络审计软件不完善
目前，我国通用的高水平的审计软件还很缺乏，主要原因是财务软件在设计时大多没有考虑专用的审计软件接口，使得在财务软件中嵌入适时跟踪监控的审计程序难以实现，使审计人员采集数据出现一定困难。我国现有的审计软件大多处于仅满足穿过计算机进行审计的阶段，现场审计和小规模的会计师事务所后期报告的制作几乎还在依赖于手工操作，规模较大的一些会计师事务所开始利用VB，VC开发更为自动化的审计系统软件。
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