对人类1号染色体上一段序列的基因生物学分析 第2页，人类第1号染色体上，包含了和很多遗传疾病有关的基因，在该染色体上截取长度为116882bp的序列进行分析，利用生物信息学技术，经过Repeat Mask，GENSCAN，Blast，Clustal w，UniGene，e-pcr等生物信息学软件分析找寻可能存在的基因，这些基因的相关功能性位点的探测，以及在相关组织中定位。确定这段DNA序列相关的基因，并了解这些基因有关的功能。
2.课程设计要求：
培养利用公共资源寻找自己需要的文献、数据等能力，学会使用NCBI上各种数据库，相关软件，锻炼从结果中分析问题。解决问题的能力。
2.1 获得DNA目标序列，学会使用NCBI相关数据库MAP VIEWER，Nucleotide。
阅读GENBANK的内容。
2.2 用Repeat Masker 软件遮蔽重复序列，学会GENSOR软件使用。
2.3 用GENSCAN探测DNA的功能性位点。GENSCAN的使用和结果的分析。
2.4 用ClustalW2、Blast，Webgene、Blast2等分析GENSCAN的结果。主要针对GENSCAN出来结果的CDS经过Blast得到相匹配mRNA基因，确定该mRNA基因是否可以由未知DNA序列转录而来。有Prom，Term等在未知序列中存在，但GENSCAN中不显现出来。是否存在新基因，假基因等。
2.5 学会用e-pcr进行DNA序列的染色体定位，用Unigene进行组织定位，并分析其相关的功能。
三、工作要求：
第一周：选择设计方向，确立设计题目，收集相关资料，下载数据，给出设计方案。
第二周：设计小程序应用于生物信息数据格式的转换，搜索并熟悉相关生物信息学软件。
第三周：应用计算机进行数据处理，编程等。
第四周：撰写课程设计说明书及答辩。
成绩评定方法：
1） 考勤占40%，过程远比
论文范文http://www.chuibin.com/ 结果重要。凡缺席三次者扣20分；
2） 完成设计任务占40%，高质量完成设计任务，有创见者得40分。有抄袭、雷同者得零分；
3） 答辩占20%。
二、课程设计图纸内容及张数
无
三、课程设计实物内容及要求
光盘一张，内容：
1原始数据和分析过程(结果文件)。
2设计说明书电子版及打印版.
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