1.5 云杉GDU家族基因的表达分析
为弄清云杉GDU家族基因的表达情况，我们从NCBI的GEO数据库中下载这个家族基因相关的芯片表达数据，进而利用TM4(http://www.tm4.org/)软件包中的相关软件对这些基因表达数据进行处理。最终，其表达热图由Cluster软件绘制(http://bonsai.hgc.jp/~mdehoon/software/cluster/software.htm)。
2.结果与分析
2.1 云杉GDU家族基因的鉴定
对拟南芥GDU基因进行BLAST得到63个云杉基因，对这63个基因进行GDU蛋白功能结构域验证[15]，证实这63个云杉基因为GDU家族基因。然后对这些基因重新命名，并进行ORF长度、EST、TM结构域鉴定得到表1，从表1可以看到云杉GDU家族基因ORF长度参差不齐分布在100~2500的范围内，EST也有多有少，TM结构域则大多只有以一个，少数没有或有两个。

表1 云杉GDU家族基因鉴定表
基因名称     基因ID号    基因匹配区段    ORF长度    EST    TM结构域模式
PaGDU1     MA_101855g0020     MA_101855:22894-23235    348    1    1(20-42)
PaGDU2     MA_102205g0010     MA_102205:4215-4439    225    6    0
PaGDU3     MA_10310271g0010     MA_10310271:6787-7242    456    11    1(31-53)
PaGDU4     MA_10429436g0010     MA_10429436:1211-1480    270    0    0
PaGDU5     MA_10429436g0020     MA_10429436:27352-27750    399    11    1(20-42)
PaGDU6     MA_10430223g0010     MA_10430223:20669-21100    432    1    2(21-43)(63-85)
PaGDU7     MA_10430994g0010     MA_10430994:7341-7691    351    5    1(15-37)
PaGDU8     MA_104842g0010     MA_104842:31166-31510    345    0    1(20-42)
PaGDU9     MA_109443g0010     MA_109443:2596-8731    6136    3    0
PaGDU10     MA_1132007g0010     MA_1132007:1447-1824    378    1    1(36-58)
PaGDU11     MA_127138g0010     MA_127138:16407-16751    345    1    1(28-50)
PaGDU12     MA_131887g0010     MA_131887:17945-18274    330    0    1(23-45)
PaGDU13     MA_132027g0010     MA_132027:111-545    435    1    1(61-83)
PaGDU14     MA_132027g0020     MA_132027:12640-13008    369    2    1(38-60)
PaGDU15     MA_132385g0010     MA_132385:599-3001    2403    0    1(20-42)
PaGDU16     MA_134410g0010     MA_134410:8723-9076    354    0    1(23-45)
PaGDU17     MA_16925g0010     MA_16925:2877-3230    354    10    1(22-44)
PaGDU18     MA_169850g0030     MA_169850:16356-16802    477    4    1(54-76)
PaGDU19     MA_170992g0010     MA_170992:1-1083    1083    1    1(20-42) 裸子植物云杉GDU蛋白异常扩增与进化分析(3):http://www.751com.cn/shengwu/lunwen_39425.html