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对羟基苯甲酸降解途径上的龙胆酸双加氧酶基因的研究(3)

时间:2020-06-12 21:55来源:毕业论文
对羟基苯甲酸的原儿茶酸开环代谢降解途径 Figure 1-1 The protocatechuate cleavage pathway for p-hydroxybenzoate catabolism 对羟基苯甲酸的脱羧酸途径 Figure 1-2 The decarboxy

对羟基苯甲酸的原儿茶酸开环代谢降解途径

Figure 1-1 The protocatechuate cleavage pathway for p-hydroxybenzoate catabolism

  对羟基苯甲酸的脱羧酸途径

Figure 1-2 The decarboxylation pathway for p-hydroxybenzoate catabolism

对羟基苯甲酸的苯甲酰-CoA还原途径

Figure 1-3 The benzoyl-CoA pathway for anaerobic p-hydroxybenzoate catabolism

 三条龙胆酸降解途径

Figure 1-4 Three gentisate degradation pathways

2 材料与方法

2.1 材料

2.1.1 实验菌株

Bacillus sp. D1菌株

2.1.2 分子生物学相关试剂

(1)DNA提取试剂盒、PCR扩增试剂盒、PCR纯化试剂盒、胶回收试剂盒。扩增16S rDNA的上游引物Ecoli16S-8F(5’AGAGTTTGATCCTGGCTCAG3’),下游引物Ecoli16S-1541R(5’AAGGAGGTGATCCAGCCGCA3’),上样缓冲液:6×DNA loading,Markers (DNA ladder):宝生物有限公司。

(2)无缝克隆试剂盒:上海生工生物科技有限公司(上海,中国)

(3)感受态细胞JM109:宝生物有限公司。

(4)Nde I, Xba I 限制酶:宝生物有限公司。

2.1.3 普通试剂

蛋白胨、酵母粉、氯化钠、琼脂条、抗生素、去离子、冰醋酸源!自`751'文"论(文`网[www.751com.cn、溴化乙锭、EDTA、Tris、Na2EDTA·2H2O、SDS、NaOH。以上试剂从上海生工生物科技有限公司购买。

2.1.4 溶液与培养基

(1)LB培养基:胰蛋白胨 10 g, 酵母提取物 5 g,NaCl 10 g,H2O 1 L,固体培养基添加琼脂粉15 g,混匀,高压灭菌。

(2)50× TAE缓冲液:100 ml烧杯中,加入Tris 2.42 g,EDTA 0.297 g ;加约80 ml蒸馏水,加入转子用磁力搅拌器充分搅拌使其充分让你溶解;再加入0.571 ml的冰醋酸,用NaOH将pH调至8.5,加蒸馏水定容至100 mL,高温高压灭菌121 ℃,20 min。

(3)SolutionI(pH 8.0的GET缓冲液):50 mmol/L葡萄糖,10 mmol/L EDTA,25 mmol/L Tris-HCl。

(4)SolutionII:现配现用,9 ml H2O,1 ml 10% SDS,200 μl 10 N NaOH

(5)SolutionIII(pH 4.8的醋酸钾溶液):60 ml 5 mol/L醋酸钾溶液,11.5 ml冰醋酸,28.5 ml H2O,混匀。

(6)X-Gal(40 mg/ml,25 ml):称取0.5 g的X-Gal固体放于大离心管中,加入12.5 ml的二甲基甲酰胺,枪头混合均匀后用1.5 mL离心管小份分装,-20℃保存。

(7)IPTG(24 mg/ml,25 ml):称取0.6 g的IPTG固体放于大离心管中,加灭菌水溶解,然后定容至25 mL,在超净工作台用滤液器过滤除菌,然后小份分装于1.5 mL离心管中,-20 ℃避光保存

对羟基苯甲酸降解途径上的龙胆酸双加氧酶基因的研究(3):http://www.751com.cn/shengwu/lunwen_54091.html
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