1.3.5 SRAP标记
SRAP(Sequence－Related Amplified Polymorphism)是一种新型的分子标记技术，其是对基因的开放阅读框区域进行扩增，使正反向引物分别与外显子、内含子或启动子区域配对，根据长度的不同而产生多态性[17]。SRAP技术具有简便、高效、共显性、易测序等优点，但由于其是对开放阅读框进行扩增，对着丝粒和端粒部分的扩增比较少，因此在构建高密度遗传图谱时，要与其他分子标记相结合。SRAP标记技术已应用于牡丹种或品种分类鉴定、杂种鉴定等方面的研究。郝青等[18]利用SRAP标记鉴定牡丹芍药远缘杂交后代，从DNA水平上检测到了与牡丹、芍药共有的特征条带，证实了杂种的真实性。这些结果对评价和分析牡丹的遗传背景、杂交育种的亲本选择及种质创新中的分子标记辅助育种是很有价值的。
1.4 分子标记在牡丹研究中的应用前景与展望
分子标记技术已在牡丹分子育种中发挥了巨大的作用，但仍有许多科学问题需要进一步的研究。
1.4.1 亲缘关系分析
分子标记技术对牡丹亲缘关系的研究已取得了很大的进展，但由于研究中受材料和种类的限制，部分研究结果相矛盾，因此牡丹种间亲缘关系并不十分清楚，对野生种与栽培品种之间的亲缘关系研究并不全面。滇牡丹、大花黄牡丹和四川牡丹在栽培牡丹品种群的起源与演化中的地位尚不清楚。今后利用分子标记技术结合形态学、基因测序等技术进行牡丹亲缘关系的研究是十分必要的。
1.4.2 品种分类鉴定
牡丹栽培品种繁多，存在同名异物、同物异名的现象，给新品种推广和品种保护工作带来了困难。目前国内外学者关于品种分类鉴定已进行了相关的研究，结果表明，基于花型或花色等形态学的分类鉴定极易受到环境条件影响。分子标记技术可在DNA水平上检测遗传差异，建立DNA指纹图谱，为品种分类鉴定提供了更准确、更有效的方法。在今后的研究中，有必要将分子标记技术与形态特征结合起来，为品种分类鉴定提供更科学、更实用的结果。
1.4.3 遗传图谱构建
分子遗传连锁图谱为进行植物基因组的结构分析与功能研究提供了有力的工具。目前，关于牡丹遗传连锁图谱的构建尚未见到相关报道。朱红霞进行了 AFLP指纹图谱构建的初步研究，为构建牡丹遗传连锁图谱提供了理论依据。牡丹高密度遗传连锁图谱，可应用于比较基因组学研究、数量性状基因定位、分子标记辅助育种等，对加快牡丹育种和种质改良具有重要意义。
1.4.4 分子标记辅助育种
分子标记辅助选择(molecularmarker－assisted selection)是利用与目标基因紧密连锁的分子标记筛选优势个体，不受环境条件和基因表达的影响，可加快育种速度，提高选择效率。目前，研究尚未发现与牡丹观赏性状紧密连锁的分子标记，但随着大量分子标记的开发，将分子生物学手段与牡丹育种相结合，对多基因控制的重要观赏性状，如株高、花色、花型等进行准确选择，对培育牡丹优良新品种具有重要意义。
目前，国内外学者利用分子标记技术在牡丹的种质资源分类鉴定、亲缘关系分析、杂种鉴等方面进行了相关的研究，并取得了显著的成果，对加速牡丹育种进程、提高育种效率具有重要意义。

2 材料与方法
2.1 材料
供试材料为保存于上海植物园科研中心的江南牡丹品种‘风丹’和日本牡丹品种‘太阳’。
凤丹（如图2-1），又名铜陵牡丹、铜陵凤丹，属江南品种群，其根皮有镇痛、解热、抗过敏、消炎、免疫等药用，具有根粗、肉厚、粉足、木心细、亮星多、久贮不变质等特色，素与白芍、菊花、茯苓并称为安徽四大名药，亦是中国34种名贵药材之一。《中药大辞典》明文记载：“安徽省铜陵凤凰山所产丹皮质量最佳”，故称凤丹。 牡丹ISSR反应体系的优化研究+正交试验设计(5):http://www.751com.cn/shengwu/lunwen_749.html