题目:Polo-Like激酶4(PLK4)抑制剂作为潜在的可口服抗癌药的计算机辅助药物设计研究
任务起至日期:11月04日至7月04日共18周
一、课题的任务内容:
本论文将采用3D-QSAR法,在SYBYL-X 2.0的水平下,以部分分子结构和生物活性(pIC50值)已知的Polo-Like激酶4(PLK4)抑制剂为训练集, 选用此系列分子的各种分子力场(立体场、静电场、疏水场、氢键供体场、氢键受体场等) 用三文定量构效关系(3D-QSAR) 方法建立反映分子结构与生物活性之间的定量构效关系模型。并基于此模型来设计新的Polo-Like激酶4(PLK4)抑制剂和进行结构修饰。30026
二、原始条件及数据:
原始资料来自查找的文献和指导教师提供的资料
三、设计的技术要求(论文的研究要求):
建立具有显著统计学意义,预测能力良好的3D-QSAR模型
四、毕业设计(论文)应完成的具体工作:
1.分子结构的搭建;
2..分子结构的优化;
3.分子的叠合;
4.3D-QSAR模型的建立;
5.模型的有效性检验、新型活性分子设计及结构修饰。
计算机软件
SYBYL-X 2.0 论文网
结 构 模 型 √
五、查阅文献要求及主要的参考文献(共20篇):
1.《Polo样蛋白激酶4的研究进展》宣君丽闰小毅周天华*。(浙江大学医学院细胞生物学研究所,杭州310058)
1.《Polo样蛋白激酶4的研究进展》宣君丽闰小毅周天华。(浙江大学医学院细胞生物学研究所,杭州310058)
2.二噁英类环境毒素及其抑制剂的分子对接和定量构效关系研究. 田青 .《同济大学》 2008
3.The Discovery of Polo-Like Kinase 4 Inhibitors: Design and Optimization of Spiro[cyclopropane-1,3′[3H]indol]-2′(1′H)-ones as Orally Bioavailable Antitumor Agents.Peter B. Sampson, Yong Liu, Narendra Kumar Patel.act
4..The Discovery of Polo-Like Kinase 4 Inhibitors: Identification of (1R,2S)‑2-(3-((E -4-(((cis)-2,6-Dimethylmorpholino)methyl)styryl)-1H-indazol-6-yl)-5′-methoxyspiro[cyclopropane-1,3′-indolin]-2′-one (CFI-400945) as a Potent, Orally Active Antitumor Agent.Peter B. Sampson, Yong Liu, Bryan Forrest, †Graham Cumming.act
等20篇
751、进度安排:(设计或论文各阶段的要求,时间安排):
求计算机应用能力和英语阅读能力较强 工作计划:要求完成下列内容: 1.分子结构的搭建;
2.分子结构的优化;
3.分子的叠合;
4.3D-QSAR模型的建立;
5.模型的有效性检验、新型活性分子设计及结构修饰。
工作计划:
第1周 — 第3周 查阅文献和收集资料。
第4周 — 第13周 分子结构的搭建、优化、模型的建立与验证
第14周 — 第15周 新型活性分子设计及结构修饰
第16周 — 第18周 撰写论文,准备答辩。
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