一、课题的任务内容:本论文将采用3D-QSAR法,在SYBYL-X 2.0的水平下,以部分分子为训练集, 选用分子的各种分子力场(立体场、静电场、疏水场、氢键供体场、氢键受体场等) 用三维定量构效关系(3D-QSAR) 方法建立反映分子结构与生物活性之间的定量构效关系模型。并基于此模型和分子对接技术来设计和研究新型抗肿瘤Combretastatin A-4 类似物。 47136
二、原始条件及数据:
来自于文献。
三、设计的技术要求(论文的研究要求):
1.建立具有显著统计学意义、预测能力良好的3D-QSAR模型。
2.设计出具有良好抗肿瘤活性的新化合物。
3.应用分子对接技术探索配、受体的结合模式。
四、毕业设计(论文)应完成的具体工作:
1.建立3D-QSAR模型
2.设计新化合物
3.分子对接
软硬件名称、内容及主要的技术指标(可按以下类型选择):
计算机软件 SYBYL-X 2.0,Chemdraw, origion等
结 构 模 型 3D-QSAR模型,药效团模型,分子对接
五、查阅文献要求及主要的参考文献论文网:
[1]徐筱杰,侯廷军,乔学斌,章威.计算机辅助药物分子设计.北京:化学工业出版社,2004:295]
[2]郭宗儒.药物分子设计.北京:科学出版社,2005:[372-373]
[3]Osman,F.G.Pharmacophore perception development,and use in drug design.California:International University Line,2000:8-9
[4]Ehrlich,P.D.Chem.Ges.,1909,17:42
[5]Gund,P.Prog.Mol.Subcell Biol.,1977,5:117
[6]Raveendra,D.;Tino,S.;Omoshile,C.;Robert,S.;Shizuko,S.;Nouri,N.J.Med.Chem.,2005,48:111
要求:中文5篇,外文10篇。
六、进度安排:(设计或论文各阶段的要求,时间安排):
教学要求: 最终设计出靶向于流感病毒神经氨酸酶新位点“150-空腔”的新型抑制剂分子。 工作计划: 1-3周:查阅文献资料 4-15周:课题研究 16-18周:撰写论文准备答辩