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Tin 小麦 降低分蘖数 可影响小麦的根冠碳分区 [5]
D3 水稻 增加分蘖 与分蘖相关 [6]
其中主要为MOC1 基因，其功能包括参与分蘖芽的形成和促进分蘖芽伸长，可减少水稻分蘖，参与分生组织起始、建立和文持。OSH1基因和控制侧芽伸长的OsTB1基因是受到MOC1 基因调控，并与水稻分生组织和侧枝生长发育相关的2个基因。水稻MOC1基因在叶腋处形成可见的分蘖枝分化突起之前即在叶腋表皮及皮下细胞中表达, 这说明MOC1 基因处于分蘖分化调控网络中的上游基因, 最近有研究表明，MOC1基因除了对OSH1 基因及OsTB1基因具有调控作用外，还存在一系列下游响应基因[3]和其他分枝调控基因, 如LAX1基因的综合作用。Li等推测MOC1 很可能是控制水稻分蘖的基因开关[4]。
此外，有研究在克隆植物赖草中发现根茎分化相关基因LRC1[3]，赖草LRC1基因与水稻MOC1基因为同源基因，LRC1基因在初花期时，在赖草根茎中的表达量即显著高于其他组织(茎、叶、穗)，特别是在根茎分化的根茎节内的表达量更高，该结果说明LRC1基因不仅仅只在根茎内表达，只是在茎、叶、穗等组织中其表达量显著低于根茎。MOC1基因的调控模式是否表示LRC1基因在除具有调控根茎分化的功能之外, 同时也具有其他调节活性，亦或是其调控根茎分化功能的发挥依赖于其他组织(非根茎)内该基因的协同表还需进一步深入研究和分析[3]。
除GRAs蛋白家族外，W. Spielmeyer 等人使用分子标记确定了一个降低分蘖数的关键基因，并将其命名为Tin基因。P.W. Hendriks认为Tin基因可影响小麦的根冠碳分区，并通过影响用水模式提高小麦的产率[4]。其他分蘖相关基因还包括调控茎数减少基因 rcn1和矮杆分蘖基因 d3[6] ，可在降低分蘖和增加分蘖两个方向上调控水稻分蘖数。
分蘖角度也会影响植株的生长状况，分蘖角度过大会增加叶面积，降低种群光合作用效率，相对较窄的分蘖角度将使株丛结构更有效率。有研究发现植物分蘖枝调控机制中，LAZY可通过调控植物生长素的极性运输，从而影响植物根的向地性而影响植物的分蘖角度[7]。
就目前情况看来，分子生物学和遗传学研究的深入发展为植物分蘖基因调控机理研究提供了坚实的理论基础。
本次实验将调查内生真菌-鹅观草共生体分蘖的相关基因，并对其进行克隆分析，一方面，对于发掘应用禾本科其他属相应功能基因奠定了基础。