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摘要：【目的】研究SLA-DRB1启动子区单核苷酸多态性（SNP）与PRRSV攻毒试验猪体重的关联性，寻找抗蓝耳病猪育种的分子标记。【方法】通过PCR扩增与测序的方法筛选出SLA-DRB1启动子区存在的SNP，并对携带不同基因型的PRRSV攻毒试验猪体重进行统计，分析不同基因型对攻毒猪体重的影响。【结果】发现g.-481C/T 位点存在CC、CT、TT 3种基因型，TT基因型猪体重在攻毒后11~42天与CC基因型猪体重存在显著性差异(p < 0.05)。【结论】SLA-DRB1启动子区g.-481C/T位点显著影响攻毒猪体重，可作为抗蓝耳病猪育种的候选分子标记。29801
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毕业论文关键词：猪白细胞抗原；PRRSV抗性；抗蓝耳病；分子标记；基因多态性
Study of the correlation between polymorphisms of SLA-DRB1 promoter region and weight of PRRSV-challenged pigs
Abstract：【Objective】The correlation between SNPs in promoter region of SLA-DRB1 gene and the weight of PRRSV-challenged pigs were analyzed to find the potential breeding molecular markers of PRRSV-tolerant pigs. 【Method】SNPs were found by PCR amplification and sequencing of the promoter region of SLA-DRB1. The mean weight of pigs with different genotypes were calculated to analyze the effect of the genotype on pigs’ weight. 【Results】Three genotypes were found at loci g.-481C/T. These genotypes are CC, CT and TT. The weight of pigs with TT genotype differed from that of CC genotype significantly during 11 ~ 42 days after being infected with PRRSV(p < 0.05). 【Conclusion】Locus g.-481C/T in SLA-DRB1 promoter region affects PRRSV-challenged pigs’ weight. This site could be the potential molecular marker for the breeding of PRRSV-resistant pigs.
Key words: Porcine leukocyte antigen; resistance of PRRSV; anti-blue ear disease; molecular marker; gene polymorphism
目 录
摘要3
关键词3
Abstract3
Key words3
引言3
1 材料与方法5
1.1 试验材料 5
1.2 试验方法 5
1.2.1 试验准备5
1.2.2 PCR扩增5
1.2.3 电泳5
1.2.4 SNPs筛选6
1.2.5 关联性分析6
2 结果分析6
2.1 扩增结果观察6
2.2 SNPs筛选分析6
2.3 基因位点多态性分析7
2.4 攻毒猪重量与基因型关联分析8
3 讨论8
4 结论9
致谢9
参考文献10
SLA-DRB1 启动子区多态性与PRRSV攻毒试验猪体重的关联研究
2006年我国爆发了一场严重的猪高热病。这场猪高热病的爆发，给中国的养猪业造成了灾难性的打击。经过研究，猪高热病的主要病原为高致病性的猪繁殖与呼吸综合征病毒（Porcine reproductive and respiratory syndrome virus，PRRSV）。PRRSV俗称为猪蓝耳病毒。PRRSV最早于1987年在北美洲被报道，之后快速传播，我国于1996年首次从疑似感染的猪体内分离到此病毒，证明我国也存在PRRSV。各种日龄、品种的猪都可以感染这种病毒，其中日龄在1月以内的仔猪和妊娠母猪是最易感染的猪群[1]。近年来虽然采取了很多措施，但蓝耳病仍然是危害到养猪生产的主要疾病，其主要表现为仔猪的呼吸道疾病和妊娠母猪的繁殖障碍，特别是隐性感染对猪只健康及增重的影响非常大[2]。由于这些特点，PRRSV是世界范围内的养猪业都十分棘手的一种病毒。
PRRSV基因组的快速变异是这种病难以控制的重要原因之一。根据基因组的序列差异，PRRSV可以被分为两个型，即在北美分离到的以ATCCVR-2332（VR株）毒株为代表的美洲型（简称B亚群）和在欧洲分离到的以Lelystad virus(LV株)为代表的欧洲型（简称A亚群）。虽然美洲型和欧洲型导致的症状相似，但两个亚群之间存在着显著的抗原与基因组差异性，两者基因组间的差异高达40%，且之间只有很少的交叉反应。因此有相当多研究者对于PRRSV的起源感兴趣。A亚群存在广泛的基因组变异，B亚群较为保守。而且两个毒株的差异越大，两者之间不相容的程度就越高。我国的猪繁殖与呼吸综合征病毒分离毒株均属美洲型，迄今还没有发现欧洲型毒株，同时我国的分离毒株也存在变异现象，现已发现有缺失变异毒株的存在[3]。2006年我国爆发的那场严重的猪蓝耳病中造成此次爆发的PRRSV病毒株经过研究发现是一种比之前发现的PRRSV毒性都要高的变异病毒。有研究表明，有多组PRRSV病毒在中国有着加速突变的迹象。因此研究对抗PRRSV的方法已经迫在眉睫。