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正因为如此，蓝藻和具原核的细菌等一起,单立为原核生物界。而蓝藻名字的由来是因为所有的蓝藻都含有一种特殊的蓝色色素。所以称之为蓝藻。蓝藻按其分类的话可以与之分成两纲。一种名叫色球藻纲，另外一种则是名叫藻殖段纲。色球藻纲藻体为单细胞体或群体;藻殖段纲藻体为丝状体,有藻殖段。蓝藻的分布可谓是非常之广泛，世界各地都可以见到它的踪影。但大多数（约75%）淡水产,少数海产[1]。甚至还有一些蓝藻，它们的生存条件是60～85C；而有一些种类它能够和菌类，苔藓、蕨类和裸子植物达到一种共生的状态的；还有一些蓝藻可以从含有钙质的岩石中穿入，比如叫做穿钙藻类。而且有一种是存在于土壤中最深的区域，比如叫做土壤蓝藻。
铜绿微囊藻里面的色素区是由含有叶绿素 a、胡萝卜素，但是除此之外还有大量的藻胆素[2]。更有甚者，铜绿微囊藻是没有常规的核膜以及核仁的。铜绿微囊藻的遗传物质存放在细胞中的一个无色区域，在其无色中央区仅含有相当于细胞核的物质，无核膜及核仁。细胞球形或者近球形是它的主要表现形态。它在水中常表现为蓝绿色。
铜绿微囊藻一般都会具备一种叫做伪空胞的物质。这种物质的作用是帮助生物在水中所承受的浮力进行相应的调整。而数量众多的中空的亚纤文被我们称作气囊，这些圆柱体存在于伪空胞里面。有些衰弱的气囊可以在外界压力的作用下消除；与此同时还会有新的气囊产生，它们是在伪空胞里面进行组装。而微囊藻调节浮力其中一种机制就是上述所说的气囊的动态变化。原始的细胞分裂就是微囊藻的生殖方式。植物幼体为球形或长圆形的实心群体，随后生长成为网络状的中空囊状体。而且通常情况下很容易在水中富集。它们会因为不断地拓展，囊体破裂而形成透明无色的网状胶群体[4]。
1.1.2铜绿微囊藻的生态学概述
水华普遍出现在湖泊当中，在温暖的季节能够大量成长。但这会对水体环境造成污染，究其原因是水华中的藻细胞向外释放毒性物质。所以环境将会受其影响。近年来，不断的有报道关于太湖，巢湖，滇池等的水华现象，这些都是由于铜绿微囊藻的过量繁殖所造成的。
目前在许多富营养化的水体当中,因为蓝藻的增殖的影响，经常会导致了大量的水华的产生,水华不仅影响了自然环境的水质,而且在某些阶段它是具有毒性的。
蓝藻具有毒性的原因是藻细胞当中含有一些毒性物质，它们是具有相当的毒性的。细胞内的毒素是蓝藻毒素的来源,然而随着时间的推移，当细胞腐败裂解后,毒素被释放到水体中，然后这些毒性物质会随着食物链进行富集。一些动物在接触到这些水体之后就会受到牵连。比如家禽，飞鸟，饮用了这些水之后，毒性物质就会进入到它们的体内，然后产生反应甚至导致死亡的产生。如果人类接触到这些水体的话，情况也会大致相似。当人们的饮用水来自这些含有毒物质的水体时，后果将会十分严重。由此而来，人们应该对水体的环境引起相当的重视，一旦水体出现水华现象，就应该关注并且注意它的发展。就目前而言，有高达十多种的藻类物质含有毒性，严重的话可以导致到死亡。本文所研究的铜绿微囊藻就是其中之一，其中水华鱼腥藻和水华束丝藻也是形成淡水蓝藻水华的主要种类,故有关的研究较多。
据研究所知，铜绿微囊藻的毒性物质是一种属于肽类的肝毒素。而这种毒素主要危害在于，如果它留在动物的肝脏里面，主要引起动物肝脏淤血肿大。更严重的话，它会破坏到细胞的形态。但是并非所有的铜绿微囊藻都产生微囊藻毒素的，这种情况也不是绝对的。因为藻类分为两部分，一部分是产生毒素，另外一部分则不产生。从外在形态来看，两者是没有区别的。而产毒株能够产生胞内毒素。然后将这些毒性物质释放到环境水体中，并且发出刺鼻的气。然而现今却还有一些学者对这个观点持相反的意见。在富营养化的水体中我们经常可以发现,因为蓝藻的过量繁殖。细胞内的毒素是蓝藻的毒素构成部分,每当细胞腐败裂解后,毒素就会被释放到水体中。然后通过饮用摄及并且通过食物链流传于生物间。更有甚者即可导致死亡，其危害应该受到重视。目前至今已经证实了多达十一种蓝藻能够引起动物中毒甚至死亡。水华鱼腥藻和水华束丝藻是形成淡水蓝藻水华的主要种类,所以相关这些藻类的研究相对来说较多。铜绿微囊藻的毒素是多肤类的肝毒素,而且这对于肝细胞有着破坏性的影响。目前大部分学者认为铜绿微囊藻的最适合生长的温度是25°C，一些学者的实验中可以证明这一点，但是也有学者持不同的观点。还有其他的报道显示铜绿微囊藻的最适合生长温度分别为32°C、35°C，同时不同的温度影响铜绿微囊藻的竞争力，进而影响到其种群优势的形成。之前有科学家做过一些实验，就是把铜绿微囊藻和栅藻放在一起培养。并计算其竞争参数，得出一系列的结果。结果显示在20°C的时候，栅藻击败了铜绿微囊藻成为了占优的一方。但是26°C和30°C，铜绿微囊藻则反之成为了优势的种群。这个实验的也印证了一个观点，就是为何在夏天的时候，夏季温度适宜，铜绿微囊藻种群的增长就会占有优势，影响到其他同级食物链的藻类的正常生长。