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    水稻(Q6ERW7.2)

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    1.2 生物信息学分析软件

    ①使用DNAMAN软件同源性比对氨基酸及核酸序列,并构建进化树。

    ②使用ExPASy网站的Protparam(http://web.expasy.org/protparam/)分析六种植物CAD的氨基酸组成、等电点、分子式、氨基酸数目、亲水性等。利用TMHMM软件(http://www.cbs.dtu.dk/ services/TMHMM-2.0/)进行跨膜区预测;

    ③使用TargetP 1.1 软件进行序列亚细胞定位分析;

    ④使用NetPhos2.0进行磷酸化分析;

    ⑤使用 EXPASY网站的SOPMA软件对CAD二级结构进行预测分析;使用EXPASY数据库的GENO3D预测分析CAD的三级结构。

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