水稻(Q6ERW7.2)
MSRHFRTHTTSRLTFPSSSGGLAITRLPFSSTSSKLLLQQLSSTSPAAAATAVTITTSSPARNLQRARASAAEQGMEEHGKAAVGWAARDDSGVLSPYNFSRRAQKDDDVTIKVLYCGICHTDLHIVKNDWGNAMYPVVPGHEIVGVVTGVGAGVTKFKAGDTVGVGYFVASCRGCECCGNGYENYCAKMVTTCNGVDHDHGGGAATQGGFSDAIVVNEHYVLRVPAGLPLDSAAPLLCAGVTVYSPMVIHGLNAPGKHVGVVGLGGLGHVAVKFAKAFGMRVTVISTSPGKRQEALEHLGADEFLVSRDAGQMAAAAATMDGILNTVSAWHPIAPLFSLMKPMAQMVFVGGPTRPLELPAYAIVPGGKGITGNCVGGIRDCQAMLDFAGEHGITAEVEVIKMDYVNTAMERLEKNDVRYRFVIDVAGSSLAGSGDAKI
1.2 生物信息学分析软件
①使用DNAMAN软件同源性比对氨基酸及核酸序列,并构建进化树。
②使用ExPASy网站的Protparam(http://web.expasy.org/protparam/)分析六种植物CAD的氨基酸组成、等电点、分子式、氨基酸数目、亲水性等。利用TMHMM软件(http://www.cbs.dtu.dk/ services/TMHMM-2.0/)进行跨膜区预测;
③使用TargetP 1.1 软件进行序列亚细胞定位分析;
④使用NetPhos2.0进行磷酸化分析;
⑤使用 EXPASY网站的SOPMA软件对CAD二级结构进行预测分析;使用EXPASY数据库的GENO3D预测分析CAD的三级结构。