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细胞去分化（de-differentiation）：分化细胞失失原有的分化结构和功能成为具有未分化细胞特性的过程。随后可导致细胞再分化成另一种细胞。
细胞凋亡（apoptosis）：细胞凋亡是指为文持内环境稳定，由基因控制的细胞自主的有序的死亡。细胞凋亡与细胞坏死不同，细胞凋亡不是一件被动的过程，而是主动过程，它涉及一系列基因的激活、表达以及调控等的作用，它并不是病理条件下，自体损伤的一种现象，而是为更好地适应生存环境而主动争取的一种死亡过程。
细胞迁移（migration）：指的是细胞在接收到迁移信号或感受到某些物质的浓度梯度后而产生的移动。过程中细胞不断重复着向前方伸出突足，然后牵拉胞体的循环过程。细胞骨架和其结合蛋白是这一过程的物质基础，另外还有多种物质对之进行精密调节
同时生物演化过程提供了许多对发病机理的提示，然而大多数的机制尚不清楚。我们将用细胞Potts模型来研究单细胞发育到多细胞器官的过程。
1.1细胞分化的生物学观点
首先，让我们来看一下单细胞和多细胞之间的差异。如果我们把一些大肠杆菌放进一立方水中，在适当的条件下，之后会产生大量大肠杆菌。但是如果我们放入青蛙受精卵，我们只能得到成年青蛙。上面的例子中的关键点是，大肠杆菌都有无限复制的潜力，而受精卵的增殖能力被分化程度抑制。因此，我们认识到，分化可能是促进多细胞器官形成的过程中最重要的事件过程。
多细胞生物在个体发育过程中，除了细胞的分裂，还多了细胞分化过程，细胞分化形成生物体的各种组织。另一方面，细胞分化的程度抑制了细胞的增殖能力。细胞分化程度越高，其分化能力越弱，如造血干细胞只能分化出血细胞，而囊胚可以分化得到成熟个体中的任何细胞。细胞的分裂和分化使细胞的数目增加，然而整个生物体不是细胞堆积起来的，细胞的分布是有层次的，细胞的排布主要是通过细胞迁移来实现的