植物内生菌的研究有着广阔的发展前景。现在内生菌的研究，大多集中在药材、粮食、水果蔬菜的内生菌研究。对于生长在极端环境中的植物内生菌的研究较少。因此，生长在极端环境中的的内生菌也可能具鲜为人知的研究价值[10]。

内生菌产生的多种次级代谢产物，具有多种生物学功能,特别是在、抗植物病虫害物质方面，抗癌方面等。在农业方面施用植物内生菌生产的抗菌剂、抗虫剂对植物病害有了很好的防治。这样减少了化学农药对环境的破坏，更好的保护了环境，促进植物果蔬朝着绿色方向发展，还使得果蔬的产量得到了稳定。在医药领域,肿瘤等恶性疾病也能被克服，内生菌产生的多种次级代谢产物能够有效抑制癌细胞的增殖，给恶性疾病的治愈带来了希望。在农业生产上也有一定的作用，植物内生菌的研究正蓬勃地开展起来,有着广阔的发展前景。

植物内生菌的研究前景虽然光明，但存在的问题也是不容忽视的。由于内生菌的生存条件比较特殊，在体外很少有和植物体相同的内环境，所以能产生能产生的次级代谢产物量还是比较有限,所以一般价格也较贵。并且，目前植物内生菌的作用机理研究的还不是特别透彻。植物内生菌次生代谢产物产量的提高，合理开发利用植物内生菌资源，寻找新的活性代谢产物，将成为今后研究的重点。

将植物内生菌真正应用于生活中，还有很长的路要走，植物的栽培条件，栽培措施、自然环境都影响着植物内生菌的生长，因此利用植物内生菌进行田间病虫害的防治，必须考虑它的多方面的因素的影响。植物内生菌是一种寄生于植物的生物活体，受植物体微生态环境和田间环境的影响，在病害生物防治中防治效果不稳定。所以，在应用与科研上必须考虑以下问题：①内生菌的相关病理学作用；②内生菌的抗病或抗虫作用。另外，通过分子生物学方法，从深层次探讨内生菌宿主的关系，这将帮助我们了解内生菌的本质[11]。

番茄拥有广泛的实用价值和观赏价值，但是，栽培番茄病害发生较重，对番茄产量影响极大。目前防治番茄病害的方法主要是喷施化学农药，这样不仅导致病原菌的抗药性不断增强，而且残留的农药也会危害人体健康。因此，生物防治以其具有高效、无毒等优势成为当今病害防治的一个研究热点。从植物内生菌分离筛选病原拮抗菌研究为生物防治探索有效新途径[12]，一方面因为植物内生菌具有固氮、促进植物生长、增加植物抗逆性、促进植物修复等作用[13]，另一方面，筛选的拮抗内生菌能辅助植物抵抗病害，所以本实验从非洲树番茄中分离内生菌及筛选拮抗菌具有重要的研究意义[14]。

以非洲树番茄作为研究材料，分离纯化其内生菌，并成功筛选出具有拮抗作用的内生菌，为进一步利用内生生进行田间防治病虫害防治，探索对非洲树番茄病害安全有效的生物防治措施与生物农药的开发奠定了基础。