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摘要：计算机技术和生物学科的结合为人类带来重要贡献，模拟预期新型分子结构也成了学者们研究的重要课题之一。本文主要研究了乙酰胆碱酯酶的分子模拟，借助计算机及其计算机算法来模拟蛋白分子构型，采用了同源建模得到了同源一致性为98.6%的模型；利用分子对接法，研究了乙酰胆碱酯酶与其抑制剂Tacrine（塔克林）和Rivastigmine（卡巴拉汀）的模拟情况，基于模拟结果发现蛋白分子与Rivastigmine抑制剂之间无氢键相互作用，但199谷氨酸与Tacrine抑制剂有相互作用，认为此抑制剂与该氨基酸结合可以抑制乙酰胆碱酯酶的活性。因此我们可以定论乙酰胆碱酯酶分子模拟得出的分子构型是合理有利的分子结构。34800
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关键字：乙酰胆碱酯酶；同源建模；分子对接；抑制剂
Molecular simulation of acetylcholinesterase
Abstract：The combination of computer technology and biology to human bring important contribution, simulated expected new biological structure also becomes one of important hot topic in the field of academics. In this paper, we mainly studied the acetycholinesterase molecular simulation, with the aid of computer and computer algorithms to simulate the protein molecule configuration,using the method of the homology modeling obtained sequence consistency in 98.6%, and molecular docking, studied simulation of rthe acetycholinesterase inhibitors with Tacrine and Rivastigmine, based on the simulation results found there no hydrogen bond interaction between protein molecules and Rivastigmine, but 199GLU acid interact with Tacrine inhibitors have, think this inhibitor combined with the GUL can inhibit the activity of acetylcholinesterase. So we can prove acetylcholinesterase molecular simulation of the molecular structure of the favorable configurations is reasonable.
Keyword：acetylcholinesterase; homology modeling; molecular docking; inhibitors
目录
绪论 5
第1章 研究内容介绍 6
1.1 酯酶 6
1.1.1 乙酰胆碱酯酶的介绍 7
1.1.2 乙酰胆碱酯酶底物抑制剂介绍 9
1.1.3 乙酰胆碱酯酶的相关测试及其应用 10
1.2 分子模拟 10
1.2.1 分子模拟常用软件 11
1.2.2 同源建模 11
1.2.3 分子对接 13
1.3分子模拟的应用 15
第2章 乙酰胆碱酯酶的分子模拟 16
2.1 乙酰胆碱酯酶的同源建模 16
2.1.1 同源建模 16
2.1.2 构建小分子模型 20
2.2 乙酰胆碱酯酶的分子对接 21
2.2.1 分子结构优化 21
2.2.2分子对接 21
第3章 分析与结果 23
3.1 分析 23
3.2 结果 23
3.2.1 同源建模-结果 23
3.2.2 分子对接-结果 24
致谢 26
参考文献 27
绪论
21世纪的今天，各方面都有了飞速的发展，科技水平显著提高。生物技术与计算机技术的发展也相当迅速，两者如何结合创新成为当今学者研究的重要课题之一。生物技术已经在医药、环境、能源、工业、农业以及海洋等方面得到了广泛的应用，也为人类做出了巨大贡献。
生物技术发展迅速，利用计算机设计构建具有预期性状的新结构或者新物种品系，利用生物体或者生物组织细胞及其结构等，来分析其各项功能和特征，并和其他工程原理结合进行生产创造对人类有利益的新兴科技。于2013年计算机模拟在化学和物理学领域获得了诺贝尔奖，可见其重要性，并且与计算机结合的学科种类繁多。
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