为研究水稻蛋白OsAGO2和OsPRMT5是否存在互作关系,需要在载体pXZP008上插入pCLEAN-G265的泛素启动子(Ubi-promoter),对pXZP008载体进行改造;再利用水稻原生质体瞬时转化体系,将水稻OsAGO2、OsPRMT5基因分别连接到表达载体pXZP008-Ubi上,转入水稻原生质体中。其中pXZP008-Ubi质粒的构建及应用为基因重组提供了一个快速有效的手段,有效提高了实验效率[1]。
图1 pXZP008载体结构图
1材料与仪器
1.1实验材料
1.1.1植物
水稻日本晴
1.1.2引物
下划线处为酶切位点
克隆pXZP008多克隆位点基因的特异引物:
pXZP008-Ubi-F CTGCAGTGCAGCGTGACCCGG
pXZP008-Ubi-R CTGCAGAAGTAACACCAAACAACAG
克隆OsAGO2基因的特异引物:
OsAGO2-pXZP008-Flag-F CCCAAGCTTATGGACTACAAAGACGATGACGACAAAATC
OsAGO2-pXZP008-Flag-R-stop CTAGTCTAGATCAGATGAAGAACATGTTGTCCACCAG
克隆OsPRMT5基因的特异引物:
OsPRMT5- pXZP008-HA-Ubi -F CCCAAGCTTATGTACCCATACGATGTTCCAGATTACG
OsPRMT5-pXZP008-HA-R-stop TGCTCTAGATTATAGGCCGACCCAATATGATCGACC
1.1.3质粒和菌株
克隆载体pCLEAN-G265,克隆载体pXZP008,大肠杆菌JM109,农杆菌GV3101
(1)主要抗生素:抗生素Ampicillin(20 ug/ml),Kanamycin(Km,20 ug/ml)。
(2)质粒DNA小量制备试剂盒(离心柱型)购置于杭州爱思进生物技术有限公司,PCR清洁回收试剂盒、琼脂糖凝胶回收试剂盒均购置于AXYGEN公司;引物均由南京金斯瑞生物科技有限公司合成;限制性内切酶,rTaq酶和T4-DNA连接酶为TaKaRa公司(Dalian, China)生产。
1.1.4培养基
LB培养基(1L)
胰蛋白胨 10 g
酵母提取物 5 g
NaCl 10 g 固体再加入 1.5% 琼脂粉。
1.2主要仪器
PCR仪、小型高速离心机、水平式电泳仪、凝胶成像系统、电子天平、灭菌锅、恒温摇床、电热恒温水浴锅、低温冰箱、烘箱及微波炉。
2研究方法
2.1 pXZP008载体的改造
2.1.1 pCLEAN-G265的泛素启动子的克隆
以pCLEAN-G265 vector-Primer为模板,以pXZP008 MCS-F, pXZP008 MCS-R为引物,反应体系(共50 ul)如下
(1)高保真PCR扩增PCR反应体系(50μl)如下:
模板DNA 0.5 μl
5×Ps Buffer 10 μl
dNTP 4 μl
Primer Star 0.5 μl
引物F 1 μl
引物R 1 μl
灭菌蒸馏水 Up to 50 μl
反应程序:98℃预变性5min;98℃变性10s,58℃退火5s,72℃延伸1min/1kb,运行30个循环;72℃ 5 min;4℃反应结束。
(2)琼脂糖电泳检测:PCR产物用1%琼脂糖凝胶电泳,120V电泳20-30min,用0.5µg/ml溴化乙锭染色,在紫外灯下观察并用Bio-rad凝胶成像系统照相。
2.1.2 DNA的回收
琼脂糖凝胶回收DNA采用AxyPrep DNA凝胶回收试剂盒,具体步骤如下:
(1)在紫外灯下切下目的DNA条带的琼脂糖凝胶,用纸巾吸尽凝胶表面液体并切碎。称量胶块重量,计算胶块体积,以1mg=1μl计算胶的体积。
(2)加入3个凝胶体积的Buffer DE-B,混合均匀。当分离的DNA片段小于400bp时,需再加入1个凝胶体积的异丙醇。
(3)吸取步骤3中的混合液,转移到DNA制备管,12000×g,离心1min。弃滤液。
(4)将制备管置回2ml离心管,加500μl Buffer W1,12000×g,离心30s,弃滤液。
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