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摘 要：分蘖是水稻等禾本科作物的分枝现象，直接影响其产量。MOC1基因是水稻分蘖的主控基因。我们利用生物信息学技术，从NCBI网站上下载水稻MOC1基因的核苷酸序列和蛋白质序列，并根据序列相似性搜索其同源序列，利用MEGA软件分别建立基于蛋白质及核苷酸序列系统发育树。结果显示，科级水平上，禾本科及棕榈科均为单系；属级水平上，稻属物种聚成了一个单系，支持率为100%。我们的研究结果为进一步研究MOC1在禾本科物种中的生物学功能提供了数据基础。29557
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毕业论文关键词：分蘖；MOC1；同源性分析；系统发育树
Homology analysis of rice tillering gene MOC1 in higher plants
Abstract: Tillering is a branching phenomenon of species in Poaceae, it influences the yield directly. The MOC1 gene is a major control gene in rice tillering. Based on bioinformatics technology, we downloaded nucleotide sequence and protein sequence of rice tillering gene MOC1 from NCBI website, and searched the homology sequences of this gene according to sequence similarity, then separately constructed the phylogenetic tree of the protein sequences and the nucleotide sequences by MEGA software. The result indicated that at the family level, the plants belongs to Poaceae and Palmae plants were monophyletic; at the genus level, the Oryza were monophyletic with a 100% support rate. Our research results provided the data foundation for further research of the biological function of MOC1 gene in Poaceae species.
Key Words: tillering; MOC1; homology analysis; phylogenetic tree
目录
摘 要 1
引 言 1
1.实验部分 3
1.1数据库的搜索 3
1.2数据处理与分析 4
2.结果与讨论 5
2.1蛋白质序列和核苷酸序列处理结果 5
2.2蛋白质序列和核苷酸序列系统发育树构建的处理结果 6
2.3讨论 10
参考文献 12
致 谢 13
水稻分蘖基因MOC1在高等植物中的同源性分析
引言
禾本科是非常重要的一个科，包括3个亚科：竹亚科、早熟禾亚科、黍亚科；中国有190余属约1200种[1]。禾本科植物颖果中含大量碳水化合物、蛋白质、脂肪等多种营养成分，有的种类还含有生物碱、挥发油和皂苷[2]。禾本科是人类粮食和牲畜饲料的主要提供者，也是加工淀粉、制糖、酿酒、造纸、编织等方面的重要原料[3]。
稻属，拉丁学名Oryza，具体分类为：植物界，被子植物门，单子叶植物纲，禾本目，禾本科，稻亚科，稻族[4]。下级分类有：光稃稻（Oryza glaberrima Stend）、疣粒稻（Oryza granulata Nees et Arn. ex Hook. F）、阔叶稻（Oryza latifolia Desv）、药用稻（Oryza officinalis Wall. ex Watt）、野生稻（Oryza rufipogon Griff）和稻 （Oryza sativa L），主要分布于南北半球热带、亚热带、亚洲、非洲、大洋洲及美洲区域。稻是有很高的经济价值的植物，除子实供食用外，秆可充燃料、编草鞋、草席或作制做纸的原材料，又可为大型牲畜的食物；谷壳是好的燃料；糠是牲畜上好的饲料[5]。
分蘖是水稻等禾本科作物在生长过程中的一个重要的分枝现象，也是一个重要的农艺性状[6]。它包含有分蘖角和分蘖力两个方面，前者反映了主茎与分蘖的集散程度，影响到株间和株内对光、气等条件的竞争；后者表现了茎蘖数的多少，决定了穗数、光合作用面积的大小和成穗率的高低，直接影响着产量[7]。因此，分蘖习性备受国内外研究者的重视，进行了广泛的研究。
水稻分蘖的形成过程可以划分为两个主要步骤，即分蘖芽的形成和分蘖芽的伸长。由于水稻的大部分营养器官，如叶片、分蘖和根系都是在这个时期形成的，因此，分蘖期是水稻生长发育过程中的重要时期。穗数是水稻产量的决定因素，而单株分蘖数又是决定穗数的重要因素。