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酸化作用破坏叶绿素，造成幼苗光合速率下降，比如王利，杨洪强等研究表明根区在酸性条件下，平邑甜茶幼苗净光合速率和气孔导度均显著下降，同时胞间CO2浓度升高。土壤酸化实际上就是根区的酸化，根区酸化直接干扰根系的结构和功能，这必然会引起植株地上部分的生理变化[12]。对水稻、芥麦、大豆和马尾松等的研究表明，溶液中的H+对植物的影响较小，但pH值的变化导致土壤中铝形态发生变化，铝毒危害植物，从而造成对植物的危害。众多研究表明，pH值的降低导致了活性氧的产生及清除失去平衡，造成活性氧对细胞的毒害，引起膜脂过氧化作用。
1.2 钙在植物中的作用
1.2.1 钙在植物中的存在形式
钙是植物的必须大量元素之一，占植物体鲜重的0.1%-5%。钙离子无色、无磁性，并且不参加氧化还原反应，在植物体内相当一部分钙与配体通过静电作用螯合，以络合态存在。依据钙在植物体内是否与配体结合，将植物体内钙的存在形式分为结合态钙和自由离子钙。 Ca2+浓度不同会导致植物体内的钙的存在形态不同。静息状态下，细胞中的钙离子浓度维持在一个较低水平（100–200 nM），从而阻止钙与无机磷酸盐结合，以避免形成磷酸钙沉淀对植物造成的毒害。因为当胞内Ca2+浓度高于1 μM，胞外达1 mM时，就会产生磷酸根沉淀，生成不溶性有机磷化物，而磷酸根是细胞能量及物质代谢所必需的。因此Ca2+浓度过高对细胞有害, 甚至导致细胞死亡。事实上细胞具有严格的调控Ca2+浓度的机制，这是由于胞质内的许多蛋白质、核苷酸、酸性磷酯都可以与Ca2+结合形成这种缓冲能力。钙库Ca2+的缓冲能力主要是由于存在一类对Ca2+高容量、低亲合力的贮Ca2+蛋白（如钙网蛋白）有关。