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本研究以水稻品系为试验材料，分别采用定性及定量PCR方法，对CaMV35S启动子基因进行检测分析，来判断该水稻是否为含有转CaMV35S启动子基因的转基因产品。
2 材料与方法
2.1 材料
阳性质粒DNA(含有CaMV35S基因)，待测样品为水稻颗粒均有由老师提供。
2.2 试剂与耗材
DNA抽提试剂盒、定性PCR用Taq酶、dNTP、MgCl2、定量PCR用2x GoldStar TapMan Mixture(with ROX)、电泳用DNA ladder maker均由康为世纪公司提供。定性及定量PCR引物、探针均由上海捷瑞生物工程有限公司合成。
2.3 仪器设备
普通PCR扩增仪、实时荧光PCR扩增仪、电泳槽及电泳仪等电泳装置、凝胶成像系统等。
2.4.1 DNA的提取与纯化
操作步骤
1）将水稻颗粒使用美的搅拌机（MJ-BL25B2）粉碎成粉末状，称取 0. 2 g粉末装入液氮预冷的2mL离心管中，加入400μl Buffer GF1和4μlRNaseA(100mg/ml)，涡旋振荡1分钟，使其充分裂解。
2）65℃孵育10分钟，期间涡旋混匀2~3次。
3）加入130μl Buffer GF2，混匀，冰上孵育5分钟。
4）将所得液体转移到已装入收集管的过滤柱中，14000rpm离心2分钟，收集滤液。
5）将收集管中收集到的滤液转移到一个新离心管中。
6）加入1.5倍体积的Buffer GF3 (使用前检查是否已加入无水乙醇），充分混匀。
7）将步骤6中所得溶液全部加入到已装入收集管的吸附柱中，若一次不能加完 溶液，可多次转入，10000rmp离心1分钟，倒掉收集管中的废液，将吸附柱重新放入收集管中。
8）向吸附柱中加入500μl Buffer GW（使用前检查是否已加入无水乙醇），10000rpm 离心1分钟，倒掉收集管中的废液，将吸附柱重新放回收集管中。
9）重复步骤8。
10）12000rpm离心2分钟，倒掉收集管中的废液，将吸附柱置于室温数分钟，以彻底晾干。
11）将吸附柱放到一个新离心管中，向吸附膜的中间部位悬空滴加50~100μl Buffer GE或灭菌水，室温放置2-5分钟，10000rpm离心1分钟，收集DNA溶液。-20℃保存DNA。
2.4.2 引物序列 来~自^751论+文.网www.751com.cn/
根据引物合成的原则，通过使用引物合成软件，分别合成定性及定量引物，
引物序列详见下表。
2.4.3 PCR检测
1、定性PCR扩增
PCR是一种体外DNA 扩增技术，经过模板高温解链变性，引物退火结合到单链DNA和在酶的作用下引物延伸三个步骤，使得DNA片段在体外呈指数增加的实验技术，该技术能在短时间内获得大量特定的基因片段[8]。本研究根据实验室的一贯实验习惯，采用25ul反应体系进行PCR扩增