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原生动物研究发展自荷兰科学家列文虎克在1667年第一次用自制显微镜观察眼虫开始，国内外的生态学研究发展迅速，主要是围绕厌氧型原生动物、原生动物在水生态系统中的作用、原生动物在食物链中的环节和混合营养、生物指示种、土壤原生动物生态、原生动物对环境胁迫的反响与适应等方面展开。随着人类对水生态系统的深入研究，越来越多的事实证明原生动物群落在水环境中发挥重要的作用。43882
2国外研究现状
国外学者对原生动物的研究有着非常悠久的历史。国外学者对德国Stechlin湖、英国Lough Neagh 湖的原生动物群落结构特征和种群动态规律与湖泊水体质量的相互关系进行了较为系统研究。德国的Stechlin湖属于典型寡营养型湖泊，水体中含有低的总磷和总氮浓度，原生动物数量低，而多样性指数高。英国的Lough Neagh 湖则为中富营养型湖泊，与前者相比而言，虽然水体中营养成分的含量和原生动物的个体数量都较高，而多样性指数则降低。两个湖的数据均表明水环境因子均与原生动物多样性有关。
3国内研究现状
国内主要是研究关于利用原生动物与群落监测和评价河流、湖泊甚至近海岸水域方面，并取得了广泛的成果和应用。有关研究表明，原生动物群落结构的特点与环境的变化之间关系密切。原生动物的种群动态、群落结构以及功能的变化都可以直接或间接的反应出水质的状况以及未来发展趋势。
国内许木启等（2001）报道了在1994年秋季至1995年冬季期间，利用传统采集的自然基质结合PFU人工基质的方法对德国柏林市郊Stechlin湖原生动物群落多样性的特征进行了研究，并记录下该湖中发现的128种原生动物。同年，许木启等也报道了白洋淀原生动物群落多样性变化与水质关系的研究[10]。研究结果表明PFU原生动物的种类组成和群集速度能够较好地反映出各个采样站水质的污染状况和变化趋势。各采样站的原生动物群落的结构参数(种类组成*751`文~论|文/网www.751com.cn、生物量、个体丰度和多样性指数d值)的变化同样也能反映出各采样站水质状况之间的差异。徐润林等（2002）通过用PFU采集的原生动物来监测广州市珠江段水质环境状况，也取得了相似的结果[7]。
贺筱蓉等通过研究认为原生动物与它们生存的水环境是相互制约、相互依存的统一整体[9]。即一旦水体受到了污染，水质发了变化，原生动物就会迅速对此变化做出相对的反应。该反应是评价水质的良好指标，以上就是水质监测的基本原理。
阳承胜等报道了利用PFU原生动物群落监测铅锌尾矿人工湿地废水净化效能[11]。研究结果显示论文网，原生动物群落的种类数，密度，生物多样性指数和集群速度均能较好的反映水质状况。其中生物多样性指数则更能有效地评价水体的质量。
谢进金等发现浮游动物的群落结构特征与水质密切相关，其中Margalef多样性指数未能较好地反映晋江流域的水质状况[16]。
吴利等采用种类数，密度，生物量对新疆伊犁地区的水质状况作出了评价，报道了新疆伊犁地区夏季浮游动物群落结构特征，但多样性和均匀度指数失败展示出该地区水质的污染状况[17]。