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虽然运筹学额与管理科学有着密切的关系，但也存在着差异，即使这些差异很模糊。这些差异是由两个学科的重点不同和专业视角不同所造成的。管理科学家更加“贴近与管理”，对事情的来龙去脉和深度特别关注。他们更关心的是，面临的真正的问题是什么？那些是重大问题？除此之外，管理专家通常采用的思维方式是咨询专家，更注重于问题的关键性，以及对可能出现的情况作出相应的判断。相对于研判问题的重要性，运筹学家将重心放在了用一些适当的技术去求解事先提好的问题上，这也是他们最关系和擅长的。在运筹学发展的初期，这些差异并不存在。当时，由于运筹学家非常注重对问题的提出以及评价这些问题的重要性上，使得运筹学在军事上发挥了巨大的威力。运筹学的快速发展以及学科体系的建立，二者之间的差异也逐渐显现出来。比如，1952年成立的美国运筹学学会和1953年成立的管理科学学会。他们在意识到管理科学与运筹学之间差异的同时，也清楚的认识到两者之间的密切联系，更重要的是强化联系比强调差异能更好的促进这两个学科的共同发展，两个学会在各自成立四十多年以后，于1995年合并为美国运筹学与管理科学学会。61286
目前，在中国的学科体系下，运筹学与控制论是作为一级学科数学下的一个二级学科，管理科学与工程是管理学门类下的一个一级学科。在国家自然科学基金委员会的学部体制下
而在，数学部与管理科学学部分别受理运筹学和管理科学的相关项目。由此我们可以看出，管理科学在某种程度上备受重视，同时也更具有相对的独立性。运筹学所涉及的范围相当广泛，交叉性较强。因此，如何看待和处理运筹学与管理科学之间的联系与区别，使运筹学和管理科学都能获得更好的协调发展，成为了中国运筹学界正在面临的一个挑战。
发展趋势
管理科学与运筹学额从一开始就有着密切的管理系，论文网在早期阶段主要是运用运筹学的理论来研究有管理背景的问题。比如，优化管理与概率论可以用来研究生产调度以及库存管理问题，线性行规划则主要针对交通问题的研究。在著名的《管理科学》杂志创刊五十周年特刊上所选的最具影响的10篇论文中，有9篇是关于优化，4篇是关于生产库存理论，1篇是关于排队论，1篇是关于建模，这足以说明运筹学在管理科学中的地位。管理科学在为运筹学的研究提供很好的实践领域的同时也提供了许多挑战性的课题，极大促进了运筹学的发展。