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嵌合基因，EML4-ALK，是由一个小反转生成2号染色体短臂内，其中EML4（2p21）和ALK（2p23），地图，通过12万碱基序列分离和面向相反的方向。编码后的嵌合蛋白，通过EML4的N-末端和激酶结构域形成ALK的，组成型二聚化，导致活化途径的批判地参与细胞增殖。以往的研究已经证明了EML4-ALK融合的致癌作用于肺上皮蛋白在转基因小鼠，它是能够开发多种肿瘤。
此外，多个EML4-ALK变种已经确定，含有ALK基因编码的胞质内的部分域（外显子20-29）以及不同部EML4基因，从依赖性的破发点的网站。两个最常见的是变体1（E13，A20）和变体3A/ B（E6A/ B; A20）发生的EML4-ALK变型，频率在非小细胞肺癌患者的33和29％，分别为。最近，一个涉及EML4和19号外显子的外显子6新变种ALK（E6; A19）已被确定。
尽管EML4-ALK的不同变体可以表现出不同的酶的活动，所有的融合变种保留NH2-EML4的赋予受体末端卷曲螺旋结构域二聚化和激酶结构域的组成型活化。
所有的生物测试的EML4-ALK的变体展示功能性能增益即使不同的研究有透露，删除或者帮助或EML4的WD域可高达50％，减少激酶活性。因此，一些变异可能比其他人更活跃。
Rikova等等。有特点的酪氨酸激酶信号跨越41非小细胞肺癌细胞系和超过150 NSCLC肿瘤。他们发现，三宗成功EML4-ALK和1例TGF-ALK相关高ALK磷酸化。因此，EML4，尽管在 最常见的，是不是ALK在非小细胞肺癌的唯一融合伙伴。
过渡联邦政府基因，放在3号染色体，以前曾报道参与在融合蛋白的形成 与ALK甚至在ALCL。三种不同的变种已描述：TFG-ALKS（短），TFG-ALK1（长）和TFGALKXL。在所有的融合蛋白，对ALK胞浆内单域和过渡联邦政府卷曲螺旋寡聚化结构域是总是保守的。
该KIF5B基因对人染色体的短臂映射10和用于马达蛋白复合物，是其成员编码与微管相关联的，并介导细胞器的运输在真核细胞。在非小细胞肺癌的新型融合蛋白 KIF5B-ALK从转位t（2;10）（P23，P11）最近已说明。在这种情况下，这种高嵌合蛋白保留在ALK激酶结构域中，而其是否激活取决于结构域中的KIF5B。
它已被提出，KIF5B-ALK中的过表达哺乳动物细胞中导致增强的细胞增殖，迁移和侵袭。
最近，一种新型的ALK伙伴KLC1已发现肺癌。 KLC1-ALK是第一部小说致癌融合蛋白仅使用福尔马林固定，石蜡包埋的组织识别和嵌合基因的转化潜力一直展示了使用实验小鼠3T3细胞。
在所有的嵌合蛋白，无论不同的ALK的合作伙伴，以下共同的特点，可以发现：转录由合作伙伴启动子活性;本地化这些融合蛋白主要是由N-术语伙伴确定与自身磷酸化和由此激活的ALK激酶结构域是合伙人的控制之下齐聚域
1.4 小分子 ALK 激酶抑制剂的结构类型
1.4.1 氨基吡啶类
辉瑞公司研究了PHA-665752 的结构，对PHA-665752结构有了重要的发现，实验结果指出该类化合物可以合成一系列的2-氨基吡啶类药物。2-氨基吡啶类化合物最早是作为c-Met 激酶抑制剂进行设计研发的，首先，以化合物a为先导化合物，对2,6-氯苯基片段进行修饰，发现了更好活性的化合物b， IC50 值达到12 no。吡啶类化合物衍生物有如下几种：苄基吡啶、卤代吡啶、氨基吡啶、溴吡啶、甲基吡啶、碘吡啶、氯吡啶、硝基吡啶、羟基吡啶、烷基吡啶、乙基吡啶、氰基吡啶、氟吡啶、二氢吡啶等。所以说它是杂环类化合物最多的一种。例如：β-氨基吡啶结构式：
1.4.2 吲哚并咔唑类
早在2006 年，Cephalon 公司就制作出了吲哚并咔唑类化合物 CEP-14083和CEP-14513。该类化合物是通过抑制ALK 的活性从而引起间变性大细胞淋巴瘤细胞死亡，这种表现可以说明明它们对ALK 具有特异选择性。