1 材料与方法
1.1 材料
1.1.1 植物材料
马铃薯栽培种Désirée。
1.1.2 菌株和载体
本实验采用从大连TaKaRa生物工程有限公司采购的pUCM-T载体及由本实验保存的大肠杆菌(Escherzchia coli)DH5α。
1.1.3 酶与化学试剂
DNA提取采用TIANGEN公司的Plant Genomic DNA Kit植物基因组DNA提取试剂盒(离心柱型);RNA提取采用TIANGEN公司的RNA simple Total RNA Kit总RNA提取试剂盒(离心柱型);胶回收采用Axygen公司的AxyPrep DNA凝胶回收试剂盒;质粒提取采用上海捷瑞生物工程有限公司的质粒小量制备试剂盒(离心柱型);PCR所用dNTP、Mg2+、buffer、Taq DNA聚合酶等试剂购于上海博彩生物科技有限公司;常规化学试剂均为分析纯试剂。
1.2 方法
取马铃薯栽培种Désirée 的新鲜幼嫩的组织根、茎、叶、匍匐茎、块茎五种材料,分别提取DNA和RNA,并且进行相应的电泳检测提取效果(条带大小、亮度),然后将RNA反转录,获得的cDNA进行半定量PCR检测基因的表达。
1.2.1 DNA提取
取植物新鲜组织约100 mg或者干重组织打约30 mg,加入液氮,充分研磨。将研磨之后的粉末迅速转移,放入预先装有700 μL 65 ℃预热缓冲液GP1的离心管中(实验前在预热的GP1中应该提前加入巯基乙醇),迅速颠倒混匀。将离心管放在65 ℃水浴20 min,水浴过程中需颠倒离心管,使样品混合数次。之后再加入700 μL氯仿,充分混匀,12,000 rpm离心5 min。将所得上层水相转入一个新的离心管中,加入700 μL缓冲液GP2,充分混匀。将混匀的液体转移到吸附柱CB3中,12,000 rpm离心30 s,弃掉滤液。向吸附柱CB3中加入500 μL缓冲液GD,12,000 rpm离心30 s,倒掉废液,将吸附柱CB3放入收集管中。向吸附柱CB3中加入600 μL漂洗液PW,12,000 rpm离心30 s,倒掉废液,将吸附柱CB3放入收集管中。重复。将吸附柱CB3放回收集管中12,000 rpm离心2 min,倒掉废液。将吸附柱CB3置于室温,放置数分钟,以彻底晾干残余的漂洗液。将吸附柱CB3转入一个干净的离心管中,向吸附膜的中间部位悬空滴加50-200 μL洗脱缓冲液TE,室温放置2- 5min,然后12,000 rpm离心2 min,将溶液收集到离心管中。
1.2.2 RNA提取
将组织在液氮中磨碎。每50-100 mg组织加入1 ml裂解液RZ,然后进行匀浆处理。将样品在15-30 ℃放置5 min,使核酸蛋白复合物完全分离。然后在4 ℃ 12,000 rpm离心5 min,取上清,转入一个新的无RNase的离心管中。加入200 μL氯仿,盖好管盖,剧烈振荡15 s,室温放置3 min。4 ℃ 12,000 rpm离心10 min,样品会分成三层:黄色的有机相,中间层,无色的水相。RNA主要存在于水相中。把水相转移到新管中,缓慢加入0.5倍体积的无水乙醇,混匀。将得到溶液和沉淀一起转入吸附柱CR3。4 ℃ 12,000 rpm离心30 s,弃掉收集管中的废液。向吸附柱CR3中加入500 μL去蛋白液RD,4 ℃ 12,000 rpm离心30 s,弃废液。向吸附柱CR3中加入600 μL漂洗液RW,室温静置2 min。4 ℃ 12,000 rpm离心30 s,弃废液。重复。将吸附柱转入2 ml收集管中,4 ℃ 12,000 rpm离心2 min,去除残余液体。将吸附柱CR3转入一个新的离心管中,加30-100 μL RNase-Free ddH2O,室温放置2 min。4 ℃ 12,000 rpm离心2 min。
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