菜单
  

    2.2蛋白质的基本分析    7
    2.2.1蛋白质理化性质的分析    7
    2.2.2蛋白质跨膜区、亚细胞定位、磷酸化分析    7
    2.2.3拟南芥GPDH信号肽的分析    7
    2.3蛋白质结构的预测    8
    2.3.1拟南芥GPDH蛋白质二级结构的分析和保守结构域的分析    8
    2.3.2蛋白紊乱区、球蛋白区预测    8
    2.3.3拟南芥GPDH蛋白质三级结构的分析与评价    8
    2.4拟南芥GPDH蛋白基因结构与定位分析    8
    2.5拟南芥GPDH蛋白电子表达分析    8
    3结果与分析    8
    3.1拟南芥GPDH蛋白序列的获取与进化分析    8
    3.2拟南芥AtGPDH蛋白与其他物种GPDH同源序列的对比及系统发育树分析    9
    3.3拟南芥GPDH蛋白的理化性质的分析    10
    3.4蛋白质跨膜区、亚细胞定位、磷酸化分析    11
    3.5拟南芥GPDH信号胎的分析    13
    3.6拟南芥GPDH蛋白质二级结构的分析和保守结构域的分析。    13
    3.6.1蛋白紊乱区、球蛋白区预测    15
    3.7拟南芥GPDH蛋白质三级结构的分析    16
    3.8 拟南芥GPDH蛋白基因结构与定位分析    18
    3.9拟南芥GPDH蛋白电子表达分析    19
    4结果与讨论    20
    参考文献    22
    致谢    23
    拟南芥3-磷酸甘油脱氢酶(AtGPDH)基因的生物信息学的分析  引言
       能源问题当今全球面临的一个严峻的问题,因此提高油脂作物的含油量成为我们首要解决的问题,油脂的主要储存形式是三酰甘油(ATG),甘油-3-磷酸脱氢酶(Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, GPDH)是一种非常重要的代谢酶,广泛存在于各种生物体中,而其催化合成的甘油-3-磷酸(Glycerol-3-phosphate,G3P)是合成三酰甘油(ATG)的重要成分,该酶参与了线粒体G3P穿梭,为呼吸链提供了电子,是G3P合成的关键酶,是连接糖代谢和脂代谢的关键酶之一,对植物的油脂合成和能量代谢有着重要的作用,根据已报道的关于G3PDH的研究,G3PDH不仅在甘油合成途径,脂肪酸合成途径,TAG合成途径以及抵抗渗透胁迫能力有重要的作用,而且在植物的免疫中也发挥着重要作用,有研究表明,将油菜种子特异性启动子控制下的酵母GPDH转入油菜中,转基因植株甘油的含量是野生型的四倍。因此,研究G3PDH的基因具有重要的理论意义,也具有潜在的应用价值。生物信息学是一门融合了生命科学、信息科学和数学等多门科学优点的综合学科,是现代一个非常重要的生物学研究工具,利用生物信息学的方法对GPDH 基因及从NCBI 拟南芥蛋白数据库下载所有拟南芥GPDH蛋白序列,并按照序列特点、进化等进行聚类分析,对其进行基本理化性质和结构预测分析,以了解其功能,为其后续的研究提供理论数据。
    1材料
    1.1生物信息学数据库与软件
    NCBI在线网站EST和Unigene ;DNAMAN在线软件软件;EXPASY在线网站的Protparam ;GOR ;SignalP;  Geno3D。
    2分析方法
    2.1蛋白质序列的获取
    2.1.1拟南芥G3PDH基因的蛋白质序列的获得
          利用NCBI中的蛋白质数据库下载拟南芥GPDH的蛋白序列。
    2.1.2拟南芥GPDH蛋白的进化分析
          应用DNAMAN软件对所获得的蛋白序列去除冗余后建构进化树。
    2.1.3同源序列的获得
         通过NCBI上BLAST程序对比直接获得与拟南芥GPDH基因同源蛋白质的序列。
  1. 上一篇:棉花根尖组织水平上微管免疫荧光抗体染色方法的建立
  2. 下一篇:Ca2+诱导的洋葱细胞凋亡研究
  1. 淮阴地区农田土壤磷酸酶活性调查研究

  2. 水稻和拟南芥BRD结构域非...

  3. 不同钙浓度对野生型拟南芥生长的影响

  4. CAS拟南芥突变体在不同钙浓度下的生理响应

  5. 水稻和拟南芥RIO非典型蛋...

  6. 磷酸盐浓度对发酵过程中无机磷利用的影响

  7. 玉米和拟南芥RIO非典型蛋...

  8. 电站锅炉暖风器设计任务书

  9. 十二层带中心支撑钢结构...

  10. 中考体育项目与体育教学合理结合的研究

  11. 河岸冲刷和泥沙淤积的监测国内外研究现状

  12. 酸性水汽提装置总汽提塔设计+CAD图纸

  13. 大众媒体对公共政策制定的影响

  14. 乳业同业并购式全产业链...

  15. 杂拟谷盗体内共生菌沃尔...

  16. java+mysql车辆管理系统的设计+源代码

  17. 当代大学生慈善意识研究+文献综述

  

About

751论文网手机版...

主页:http://www.751com.cn

关闭返回