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1.2 植物铝胁迫蛋白组学研究进展源'自:751-'论.文'网"]www.751com.cn
1.2.1 植物蛋白组学研究方法
植物蛋白组学是蛋白质功能模式和蛋白质表达模式的研究科学[8]。常规的研究方法是将植物组织或器官里的蛋白质提出处理，经过蛋白质的双向电泳分离形成一个二维图谱，用计算机软件分析该图谱，就能得到该目标蛋白质的分子量和等电点等一些数据，在利用质谱的分析技术来鉴定蛋白质，把所有得到的数据总结建立一种在特定条件下的蛋白质表达方式的数据库，与已有的数据比较就能得出我们想要的结果。而蛋白质组学研究的最终目标是蛋白质功能模式的研究，它是提示蛋白质分子与分子之间相互作用的方式，并深层次了解蛋白质结构与功能的相互关系，以及基因序列与蛋白质分子结构功能的关系等等[9]。当前，蛋白质组学研究的主要方法仍是双向电泳和质谱分析技术。双向电泳技术是依据蛋白质两个物理化学的不同的原理来分离蛋白质，即蛋白质的带电性和分子量大小的差异，经过两次凝胶电泳后就能达到分离蛋白质的技术。第一向电泳是等点聚焦电泳，利用蛋白质的等电点的不同将带不同电荷的蛋白质进行分离。在第一向电泳的基础上，第二向进行的是SDS聚丙烯酰胺凝胶电泳，它依据的原理是蛋白质分子量的不同。
蛋白质组学研究的第一步是蛋白质的分离技术，将蛋白质成功的从植物体中分离，决定了后续研究得到的数据的准确性和可信性。接下来就是对成功分离的蛋白质进行染色，常用的染色方法有考马斯亮蓝染色法、荧光染色法和银染法，对不同的蛋白质进行染色要用到不同的染色方法。其中分辨率最低的是考马斯亮蓝染色法，但在银染色过程较繁琐，而且还要使用醛类物质，对蛋白质会进行烷基化作用，将会影响蛋白质的后续鉴定。染完色的2-DE凝胶图后需要进行扫描后用于软件分析，只有扫描质量好的图像才能进行准确的图像分析。通过这些植物蛋白质组学研究中的实验技术，我们就能得到植物蛋白质数据，接下来需要利用生物信息学技术对这些数据进行整理、归纳、检索、统计等。