本研究通过建立高效多菌灵降解菌株djl-10的基因文库,为研究djl-10基因组结构功能及降解多菌灵相关基因奠定基础。
2 材料与方法
2.1 培养基与试剂
基础培养基(MSM)组成:NaCl 1.0g,NH4NO3 1.0g,K2HPO4 1.5g KH2PO4 0.5g,MgSO4 ·7H2O 0.2g,去离子水1000mL,pH7.0。
LB培养基的组成:蛋白胨(OXID)10g,酵母粉(OXID)5g,NacL l5g,去离子水1000mL,pH自然。固体LB培养基加入15g/L琼脂粉。
试剂:Amp抗生素购自Amresco,回收试剂盒购自AXYGEN公司,内切酶BamHI,T4DNA连接酶,各种载体购自宝生生物工程(大连)有限公司。
2.2 供试菌株
实验室保存的一株多菌灵高效降解菌株djl-10,该菌为前期研究中从多菌灵废水处理系统活性污泥中分离获得。
2.3 主要仪器
超净工作台,DYY-6C型电泳仪,电热恒温振荡水槽,全温振荡培养箱,离心机,摇床等。
2.4 菌株基因组文库的构建
2.4.1 菌株基因组DNA的提取
取100mL的菌体培养液12000g,5min离心,50mL TE(pH8.0)重悬,洗涤并离心;加溶菌酶至100µg/mL终浓度,37℃过夜至体系变清;在上述澄清体系中加入1.5mL 10% SDS和150µL的蛋白酶K,混匀,于37℃温育1h;加入5mL 5mol/L Nacl,充分混匀,加入4mL CTAB/Nacl溶液,混匀后再65℃温育10min;加入等体积的酚/氯仿/异戊醇剧烈震荡抽提,12000g,5min离心,将上清转入一只新管中;重复上一步骤几次,直至不出现白色界面;加入等体积的异丙醇,轻轻混匀,直到DNA沉淀下来,用烧成钩状的玻璃毛细管捞起DNA沉淀;DNA沉淀用70%的乙醇洗涤几次,置于洁净工作台中风干;用适当体积的TER缓冲液溶解DNA,准备电泳检测。