基于叶绿体psbA-trnH基因间隔序列的酸浆属植物的分子鉴别(2)

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2.1 基因组DNA提取质量结果 8

2.2 样本序列信息 9

2.3 不同DNA条形码候选序列barcoding gap检验 10

2.4 不同DNA条形码序列种内种间差异分析 11

2.5 酸浆属DNA条形码候选序列鉴定效率评价 12

2.6 系统进化树分析 12

3 讨论与结论 13

参考文献： 15

引言

酸浆属植物介绍

酸浆属（Physalis）是茄科（Solanaceae）中的一个属，为多年生草本植物。该属植物广泛分布于全世界，在我国主要分布于华东、华中、华南及西南等地，常存在于海拔500～1 500m的山谷林下及村边路旁，浙江各地均有所分布。在我国南北方均有其野生种，以东北地区分布较广，主要分为两大品种。其中一种为黄果酸浆，俗称“洋姑娘”，其原产于中南美洲，后又由法国传入中国，经过适当改良，增大其果形，使其具有具有较强的观赏价值和食用价值，风味酸甜。另一种则引自日本，为红果酸浆，又称红姑娘、锦灯笼、挂金灯等。其原产于亚洲，相较于黄果酸浆，红果酸浆的果实品质较差。[1]酸浆属果实内含丰富的维生素C、Ca、Fe和胡萝卜素等20多种矿物质，以及18种人体所需要的氨基酸，是植物中少有的集食用、观赏、药用价值于一身的植物资源，具有较高的研究价值和广阔的利用空间。

由于历代本草书籍中对相关中草药的记载存在较大差异；部分药材随历史沿革产生品种变迁；正品药材经常短缺，难以满足市场需求，民间常用其他类似品种取而代之，市场上代用品的随意使用使得中草药品种复杂混乱的局势不断加重；同时，中草药领域的鉴定遇到了较大的瓶颈，经典中草药的性状鉴定、显微鉴定和理化鉴定存在着一定的局限性，难以满足现代需求，且鉴定方法的缺失导致了多起严重的安全性事件。因此，分子水平的中草药鉴定技术的发展显得尤为重要。

因此，本项目拟在对酸浆属植物种质资源的广泛调查、采集及形态性状指标统计的基础上，通过DNA条形码psbA-trnH序列对酸浆属植物的比较研究，建立通用性好、省时经济、操作简单、实验过程标准化的酸浆属植物DNA条形码鉴定体系，实现高通量快速鉴别。本研究对酸浆属种质资源的保护、进一步开发及可持续利用有重要的研究意义。

研究现状

目前，国内外针对酸浆属植物的研究主要集中于其药用价值、临床应用、药理学作用以及其遗传转化方面，而鉴定分类及种群遗传多样性方面的针对性研究还处于相对空白阶段。DNA条形码技术在动植物鉴定方面的研究较多，在生活中主要应用于司法鉴定、生物多样性保护，并得到了各界媒体的广泛关注，为其在鉴定领域的应用奠定了基础。国家药典委员会讨论并通过将中药材DNA 条形码分子鉴定的指导性原则列入《中国药典》的增补本中，该指导原则通过对大量的样本中药材进行针对性的DNA 条形码分子鉴定研究，并且以ITS2 为核心，psbA-trnH为辅，建立植物类药材DNA 条形码鉴定体系，以COI 为主、ITS2 为辅，建立相应的动物类药材DNA 条形码鉴定体系。[2]同时，中药鉴定学与叶绿体基因组学基于叶绿体基因组结构具有简单、稳定、用通用引物易PCR扩增、测序等优点，进行了有机结合。首先提出“利用叶绿体基因组进行中药材道性鉴别”的学术假设，逐步突破传统分子标记内在鉴定能力的瓶颈，绕开核基因组的高复杂度，开发种群水平、物种特异鉴定标记。此平台技术的建立具有典型的示范效应，可进一步推广到所有多基源和多产地用药的中药品种。