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(5)相对于纯菌种，复合菌剂适应培养基和环境因子变化的能力强，整个生物体系较为稳定。
1.2.2 复合细菌的构建
复合菌剂的构建原理是将来自特定环境中具有特定功能的微生物菌群针对不同的处理体系进行科学组合，构建出高效的或具有特定功能的菌群。其构建过程首先是对微生物进行优选、驯化，将具有不同功能的菌群提取出来，然后针对各类工业废水、天然水体、市政污水、生活垃圾和养殖场等不同处理对象、环境，经多次组合搭配，构建出最优组合的复合菌剂[10]。
复合菌剂是由两种或多种微生物按合适比例共同培养，充分发挥群体的联合作用优势，取得最佳应用效果的一种微生物制剂。复合微生物制剂的来源主要有三个方面：
(1)现有的EM菌群。EM有效微生物群组成复杂，结构稳定，功能广泛。在提高农业、牧业、林业、水产业的生产能力，在治理环境、保护环境、创造优化环境，在人体保健等方而都具有巨大的作用和潜力。
(2)根据所应用的环境条件和所达的目的，用大量微生物物种配置的，优化处理的微生物制剂。
(3)为达生产高效而构建的人工菌种或菌种的群体制剂[11,12]。
1.2.3 复合菌剂的应用
复合菌制剂较单一菌株的作用效果要更好。复合菌制剂一般都具有协同作用，因此呈现出由单一菌株微生态制剂向复合微生态制剂发展的趋势。复合菌剂在环境保护的应用十分广泛，应用于治理水体富营养化，土壤改良，处理污水，分解污泥等。复合菌剂修复技术是20世纪70年代发展起来的一种新型水处理技术，是当前水处理技术的主要方向之一。复合菌剂修复技术是利用天然存在的或特别培养的微生物，在精心选择、合理操作、人工强化的环境条件下利用水体中有机物和各种形态的氮、磷进行同化和异化作用，促进或强化在天然条件下原本发生很慢或不发生的降解反应能够快速有效进行，从而将有毒污染物转化为无毒物质的技术[13]。
将复合菌剂添加于活性污泥系统处理实际生活污水，发现复合菌剂可以加速活性污泥系统的启动并具有较强的耐冲击负荷能力。复合菌剂强化活性污泥处理生活污水的条件为，用量1/80~1/40、溶解氧3mg/L~4mg/L、曝气时间6小时。在此条件下，在单纯使用活性污泥的对照组中，COD去除率达为54~73％，污泥指数为77~94mL/g，活性污泥絮凝性为42~45％，而添加了复合菌剂的试验组可以使COD去除率达到70~78％，污泥指数达到66~84 mL/g，活性污泥絮凝性达到49~57％，优于对照组。复合菌剂在SBR反应器中强化活性污泥处理生活污水有效期为30天，以30天为周期向 、其中重复投加复合菌剂不会降低强化效果。序批式活性污泥(简称SBR)是一种削歇运行的活性污泥法废水处理工艺，兼均化、初沉、生物降解、终沉等功能于一池。在一个运行周期中，各个阶段的运行时间，反应器内混合液体积的变化，以及运行状态等都可以根据具体废水性质、出水质量与运行功能要求等灵活掌握。焦化废水脱氮过程中，由于硝化阶段需要好氧，反硝化阶段需要缺氧，并且硝化与反硝化所需PH值、停留时间不同，这些都可以应用SBR工艺实现。由于自动化程度的提高，近年来在国内外被引起广泛重视。
对复合菌剂强化活性污泥处理生活污水的机理进行了初步分析，表明丝状菌的骨架作用和微生物絮凝剂的粘结以及絮凝作用增强了活性污泥的絮凝和沉降性能。活性污泥絮凝和沉降性能的增强以及微生物絮凝剂的絮凝作用使出水中的悬浮物和胶体减少，COD去除率增加。另外，复合菌剂促进了活性污泥中原有微生物的种群的变更和重排，大量具有高度降解作用的优势菌种使污染物降解速度加快、生物量的快速增加，从而有利于污染物降解。