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1.6.2 化学法
化学法的机理是渗透剂透过细胞壁后与细胞膜的脂质反应，破坏其结构和流动性，使其失去原有的对胞内外物质传递的调控能力。由于不同来源的细胞膜化学组成和复杂性不同，化学法对不同细胞透化效果的规律性较差，但该方法较容易放大和应用于工业生产。
化学法主要包括有机溶剂法、去垢剂法以及螯合剂法等。有机溶剂法常用的试剂主要有甲苯、乙醇、氯仿、丙酮等；去垢剂法主要用洋地黄皂苷、 溴化十751烷基三甲基铵(CTAB) 等；螯合剂法主要用乙二铵四乙酸(EDTA) 等。透性化处理操作时，通常是选取一种或几种不用的试剂、在不同的作用条件下(浓度、温度、反应时间等)对细胞进行处理， 比较不同试剂的处理效果，选用最佳方法[25]。
1.6.3 生物法
生物法是指使用一些生物分子如酶、 抗生素、多糖、磷脂以及一些病毒糖蛋白等对细胞进行透性化处理的方法。目前，生物法主要用于研究上述分子抗菌活性的作用机制和特点[25]。
1.6.4 分子生物法
近些年，基因工程技术也被用于菌体细胞对底物和产物通透性的改善，与传统的化学法和物理处理法相比，分子生物学法对细胞破坏小，甚至没有破坏，可以充分保证细胞活性，尤其适合涉及辅酶再生以及复杂生化反应的体系。目前，分子生物学法改善细胞被膜传质阻力的策略主要有3种，即通过基因工程技术使突变菌株改变细胞外膜结构和组成，表达底物或者产物转运蛋白，表达生物膜激活肽[25]。