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3．服务理念和服务方式有待进一步转换。由于受长期以来较为严重的官僚主义思想作风的影响，公务员短时间里还无法适应管理模式由管理型向服务型转变。“政府机关是管理部门，与文件打交道是政府部门的主要工作方式。政府网站的实施使政府部门要直接面对公众的大量反馈信息，要改变公文旅行、文山会海的办公方式和衙门作风，有相当一部分公务员在短时间内无法适应这种角色和工作方式的转换。” [3]一些政府网站尚未树立以公众为中心的服务理念，仍以政府为中心进行相应的建设。总是习惯考虑政府如何方便，而不是以方便企业和公众为出发点来整合信息，严重影响了政府网站作用的发挥，造成资源浪费，效率低下。加强门户网站的建设，切实树立以用户为中心的建设理念，真正从群众需求出发，从老百姓需求出发设置一些服务事项和栏目。
4．社会公众对政府网站的接受程度还十分有限。我国上网人群中，主要是青少年阶层，而他们对政府网站的需求相对较弱。许多公众对政府工作的程序和规范缺乏了解，对政府网站实施后带来的便捷服务缺乏了解，对依靠政府网站解决问题缺乏信心。这都严重影响了公众对政府网站的认识和心理认同。
（二）各自为政的现象严重，跨部门业务协同和信息共享有待加强。“目前我政府网站的建设和应用还是处于分割状态，还是以各部门和各地方分散的、各自为政的方式行使行政管理职能和提供社会服务，缺乏互联互通和集成整合；” [3]并不是按照统一组织和规划的原则来建设的，而是在不同时期、在各自不同的条件下由各部门、各地方自主建设的。各部门之间、各应用系统之间不能很好地共享信息。在业务运作过程中，用户常常需要从一个系统切换到另一个系统，进行多次点击，或者多次重复输入相同信息，结果造成数据准确性差、公众办事效率低下和不便捷、公众不得不在多个应用系统之间来回寻找服务等一系列问题。
（三）信息公开力度不够，政务公开缺乏法律保障。政府为了树立好的政府形象，有选择性的进行信息公开。信息公开的内容不够全面，丰富，不能使公众准确了解政府，公开的信息也不能满足公众的需求。信息公开力度不够不利于透明政府的建设。这说明要加大政务公开的立法建设，提高信息公开的规范性和丰富性，政府网站需要加大对信息公开规范性的引导。
（四） 政府网站建设存在潜在的安全问题。政府网站关系到整个国家的利益，政府网站的安全问题是十分重要的。政府网站是通过网络平台管理公共事务和传递公共服务的，在这个过程中，政府网站的应用系统按照设计的计算机固化的业务流程来进行管理。因此，要做到公众通过网络就能获取政府信息和服务，就必须在网上公开管理过程、实行政务信息公开，这样就出现了政府网站安全问题。系统安全是政府网站建设中的重要顾虑之一，出于安全考虑，许多机构放弃通过电子系统交流保密信息，这很大程度上阻碍了电子政务的发展。互联网是开放的网络，只有采取一定的安全措施，才能使网站的正常运行得到一定的保证，才能保证更多人访问到需要的网站。
（五）政府网站建设的目标有待进一步明确。我国政府网站建设的目标和出发点具有多样性，发展目标不明确。在国内，我国正处于社会转型、体制转轨的历史过渡时期；在国际上，国际竞争越来越激烈，经济全球化和市场化，社会信息化、管理民主化的趋势日益明显。这些客观环境条件，必然造成对政府政务活动的影响。因此，我国政府网站的发展势必要满足和保障这些目标的实施，政府网站建设的出发点具有多样性，同时政府机构对政府网站没有明确的认识与理解，至于为什么要政府上网，政府上网起到什么作用，政府上网要达到什么目标才算成功都没有好好考虑，使政府网站没有正确的定位，发展目标不明确，没有做到为建设服务型政府服务。“政府网站的实际理念应当体现服务于公众，服务于企业的发展，服务于城市经济的发展，服务于民主制度的健全。形式上要体现政府网站的服务功能，而不是现实政府的网络再现。” [4]目前政府网站在设计定位上缺乏明晰的逻辑，网页设计不合理。