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（1）目前存在的问题:
运算效率,软件复杂,系统安全的隐患虽然SDN对于传统的网络有很大的优势，是未来网络的发展放向，但是目前存在着很多的问题，运算压力大；软件的复杂度比较高，系统的稳定性欠缺，在SDN下系统需要为每一个流制定出优化的路由策略，运算压力就必须很大，且压力会随着控制网元的数量增加呈几何形式上升，而为了实现网络的可编程序，应用程序将会被赋予大量对环境的控制权，这又将产生很大的安全隐患，很可能导致系统崩溃，因此在软件复杂度和运算效率这两者之间将是SDN面临的挑战[3]。
（2）网络集中控制产生的负面隐患
由于SDN采用的是集中控制架构，这必将带来“单点失效”的固有缺陷。