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摘要：基于前期RNA测序结果，筛选出了重要差异表达基因：猪干扰素γ。干扰素（IFN）是动物机体受到病毒入侵时由细胞所合成并分泌的一种具有生物活性的物质，在抗细菌、抗病毒、抗肿瘤以及免疫调节等方面扮演着重要角色；为进一步研究猪干扰素γ（IFN-γ）在猪免疫应答反应的重要影响，本研究初步采用PCR扩增及直接测序技术检测到猪IFN-γ基因外显子4区域一个SNP（g.5330, T>C），经蛋白质预测该SNP为错义突变，由异亮氨酸变为苏氨酸，这为下一步在群体内探讨此SNP位点与血清干扰素γ浓度的相关性奠定了基础。26237
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毕业论文关键词：干扰素γ基因；单核苷酸多态性；猪
Identification and analysis of porcine IFNγ gene
Abstract: Based on the results of RNA sequencing, we selected out the important differentially expressed gene: porcine interferon gamma (IFNγ). Interferon is a kind of bioactive substances of the animal body by the cell synthesis and secretion when the body is invaded by virus invasion, and it also plays an important role in antibacterial, antiviral, anti-tumor and immune regulation; For the further study the important influence on pig immune response of porcine interferon gamma gene, the PCR amplification and direct sequencing were used to detection exon region of porcine IFNγ gene, and a SNP (g.5330 T>C) was identified, then the protein was predicted that the SNP was a missense mutation, the encode protein was change Isoleucine to Threonine, these results provided the foundation for further investigation of the association between the SNP and serum interferon gamma concentration in the pig populations.
Key word: IFN-γ gene; SNP; Pig
目 录
摘要 1
关键词 1
Abstract. 1
Key words 1
引言 1
1 材料与方法 2
1．1 实验材料 2
1．1．1 实验动物 2
1．1．2 实验用品和主要试剂 2
1．1．3 实验仪器 3
1．2 常规溶液及试剂配制 3
1．3 试验方法及步骤 3
1．3．1 引物合成 3
1．3．2 基因组的提取 4
1．3．3 基因组的检测 4
1．3．4 PCR扩增 4
1．3．5 琼脂糖凝胶电泳 4
1．3．6 PCR产物测序 5
2 结果与分析 5
2．1 基因组检测结果 5
2．2 PCR扩增结果 6
2．2．1 不同引物的梯度PCR检测 6
2．2．2 不同引物的PCR扩增结果 6
2．3 猪干扰素γ基因多态性检测 7
2．4 实验结论 8
3 讨论 8
致谢 9
参考文献： 10
干扰素γ的鉴定分析
引言
干扰素是动物机体中最重要的细胞因子之一，其主要生物学功能体现为广谱的抗病毒功能和强大的机体免疫调节功能。于1857年由英国科学家Alick Isaacs和瑞士研究人员Jean Lindenmann利用鸡胚的绒毛尿囊研究对流感病毒的干扰作用时发现。由于这种新发现的糖蛋白能够干扰病毒在机体内的繁殖，且具有高度的生物学活性，因此将其命名为干扰素（Interferon, IFN）[1]。根据基因和蛋白结构以及功能特征的差异，干扰素在哺乳动物中又被划分为三大类：I型、II型和III型干扰素。其中I型干扰素主要包含IFN-α，IFN-β，IFN-τ，IFN-ω等，其基因结构中不存在内含子，主要在机体早期抵抗病毒的感染发挥重要的作用；II型干扰素只包含一种类型：IFN-γ，其基因结构含有内含子，主要在机体获得性免疫反应中发挥重要的作用；III型干扰素包含IFN-λ，它与I型干扰素在基因结构和功能上非常相似，在基因结构中也不含有内含子[2]。正因为干扰素在机体中发挥非常重要的作用，近几十年来，关于干扰素的研究一直是细胞学、病毒学以及分子生物学等相关领域热点课题；同时，干扰素的调控机理也成为研究热点。