非洲大麦种质资源遗传多样性研究

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摘要大麦作为水稻、小麦和玉米之后种植面积第四的农作物，应用前景十分广泛。为了探究非洲大麦种质资源遗传多样性，本实验对33份来自非洲不同地区的大麦种质资源，利用22个SSR分子标记的合引物进行PCR扩增，再利用聚丙酰胺凝胶电泳、银染等技术将SSR标记的分子用长短不一的条带表现出来。实验结果通过0-1矩阵整理出实验数据，再通软件进行分析，数据分析显示， 22个合引物共扩增出95个等位基因，平均每个合引物检测到4.3个等位基因。具有多态性位点有75个，占总数的78.95%，其中＜5%的稀有位点有1个。Shanmon指数范围在0-0.69之间，平均值为0.358，属于具有较高多态性。多态性性位点中多态性位点最对的引物有5个，分别都有6个多态性位点，其中引物HVP361具有很高的多态性。结构分析出其同源性除了埃塞尔比亚之外的其他国家都具有较高的同源性。这些结果为之后的遗传育种和不同品种大麦的同源性等实验工作提供了基础。47438

Abstract

As a former world barley crop acreage of four, are reflected in all aspects of its value. To explore the genetic persity of barley germplasm resources in Africa, this study, 33 of barley germplasm from different parts of Africa, the use of 22 SSR markers synthetic primers for PCR amplification, re-use of polyacrylamide gel electrophores is and silver staining. SSR molecular marker technology manifested by strips of varying lengths. The results sorted out by 0-1 matrix experimental data, and then pass software for analysis, data analysis, 22 primers were amplified together 95 alleles, the average combined primer 4.3 alleles detected. Polymorphic loci have 75, accounting for 78.95% of the total, where <5% of the rare sites have one. Shanmon index ranges between 0-0.69, with an average of 0.358, is having a high polymorphism. Polymorphism of the sites most polymorphic loci primer pair has five, each of which has six polymorphic loci, which HVP361 with high polymorphism. Structural analysis in addition to its homology to other countries outside of Ethiopia have high homology. After genetic breeding for these results, different varieties of barley and other homology provide the basis for experimental work.

毕业论文关键词：大麦 SSR 遗传多样性多态性分析

Keyword: Barley SSR Genetic Diversity Polymorphism

前言···5

1 试验材料、实验试剂与实验器材 5

1.1试验材料···5

1.2 实验试剂···5

1.3 实验器材···5

2实验方法·5

2.1大麦种质资源获取···5

2.2大麦叶片DNA提取···6

2.3 SSR-PCR标记及PCR扩增7

2.3.1.1 SSR-PCR标记7

2.3.1.2 SSR-PCR标记合引物筛选··7

2.3.2 PCR扩增··8

2.3.2.1PCR扩增程序8

2.3.2.2聚丙烯酰胺凝胶电泳··8

2.4 数据分析···9

2.4.1 数据处理·9

2.4.2 标记多态性分析···9

2.4.3 遗传结构分析·9

3 实验结果与分析9

3.1数据处理9

3.2 SSR引物多态性分析··10

3.3 遗传结构分析···13

4讨论··14

参考文献15

致谢17

前言大麦是世界上最重要的农作物之一，种植面积仅次于水稻、玉米和小麦，位居全球种植面积第四位，主要用来作为粮食、制作啤酒和牲畜的饲料等[1]。非洲地区地域辽阔但由于贫瘠干旱的土地特性，所以很少有作物能够在此区域内很好的生存下来，然而大麦确是一个能够适应这种艰苦环境的农作物[2]。大麦在近一些年的种质面积呈现递减的趋势，但大麦的总产量减少的比例低于种植面积减少的比例，这说明由于科技的进步，大麦的单产有显著的提高[3]。现今，非洲地区大麦的单产和种植面积都相对较低，本实验研究非洲地区大麦品种遗传多样性，这成为一个契机来提高非洲地区大麦的产量，为非洲地区的人们提供一个全新的发展之路。