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目前国内可可加工企业主要集中于长三角地区，目前规模较大的共有751家，其中上海3家，无锡2家，绍兴1家，他们是：上海金丝猴集团无锡可可制品有限公司（前身为华新可可加工厂，年加工量2万吨）、上海大明可可加工厂（1.5万吨，属上海市油脂公司）、浙江绍兴启立星光可可加工厂(1万吨，属当地粮食局和澳门南光公司合作)和申德可可加工厂（1万吨，属中茶公司，上海茶叶和美国三利公司合资，中茶公司控股73%）、无锡华东可可有限公司（10000吨，成立90年代）。这6家厂占了可可豆进口加工、可可油出口销售、可可粉内销总量的半数以上，但相对其他国家的先进可可加工企业而言，中国可可加工的企业规模普遍偏小，行业整体规模也非常小。
我国可可加工业发展前景还是十分广阔的，但总结目前我国可可加工业存在的问题，也成为影响我国可可加工业走向的主要问题。
1）国内加工企业规模小、产品技术含量低，因此没有明显的特色优势。
由于国内加工企业设备普偏较老旧，技术较落后，所以不仅生产成本高，质量还与先进企业的差距较大，自然生产出的可可脂也只能低价售卖。目前，国际上大型的可可加工企业，如艾地盟（ADM）、嘉吉（Cargill）等，年加工能力至少在5万吨以上，以规模大、产品较单一、低成本为核心竞争力；中小型企业，如欧洲的众多工厂，年加工3万吨左右，以用户订制个性化产品、差异化服务为竞争优势。在激烈竞争中，我国可可制品行业的洗牌和整合势在必然，如果不能在规模和技术上提高实力，则可能被淘汰。
2）代可可脂，及类可可脂抢占大部分中低端市场，国产纯可可脂无人问津
即便国产可可脂价格低于国际水平，国内中低档制造商从成本考虑，宁愿用便宜的类可可脂（13000元人民币/吨）来制造产品，也不愿使用纯可可脂（现价约120000元人民币/吨），这也是造成国产可可脂大量出口的原因。
3）利益熏心，以次充好，妨碍行业发展
目前仍有一些企业受利益驱动，不能按产品标准生产，比如在可可粉产品中大量添加可可皮渣，降低产品质量并以廉价价格充斥市场，这也在一定程度上影响了可可加工业健康的发展。针对这一情况，国家质检总局从2008年底开始，对可可加工行业进行专项整治，国家将对整治中查出的违法行为给以惩处。[9]