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2.2 SYBYL软件简介
SYBYL/Base,是Tripos药物发现软件的核心。它提供了一套完整的分子结构搭建、编辑和可视化的工具。其功能包括:分子模建与编辑、计算(分子三文结构优化)、数据分析与组织、分子在三文空间的图形表达和注释、高质量图形输出及用户定制等等。SYBYL/Base内嵌多种力场,包括Tripos , AMBER,MM2和MMFF94s,适用于药物设计相关的各种体系。在SYBYL/Base内用户可以通过分子表单(Molecular Spreadsheet)来计算,
管理
,显示和分析分子的特性。灵活的输入输出方式可以让用户方便使用通用的数据库资源。用户使用内置的脚本语言SPL (SYBYL Programing Language)能够将复杂的分子模拟和药物设计过程自动完成,实现自己的药物设计理念。
它的应用体现在以下方面:
1. 显示和研究新的化学实体;
2. 通过分子表单组织和分享分子数据;
3. 构建和优化分子模型;
4. 将不同来源的数据统一起来;
5. 定制习惯的药物发现方法。
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