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深井曝气法相比普通活性污泥法优在高效。该系统能耗低，节约投资及运转费用;适用于处理东高浓度的工业废水；耐盐度高；污泥回流量需根据菌种生长速度加以调整，因深井里出来的菌种处于耗氧阶段，回流量不能过大，否则会进一步自身氧化，增加了对污水的冲击力，过小可能会产生厌氧菌。东北制药总厂的高浓度有机废水经深井曝气池生化处理后，CODcr去除率达到92.7%[9]，由此看出其去除效率是很高的，有利于下一步的处理，出水要求严格达标。
生物膜法是和活性污泥并列的一种生物接触氧化生物处理技术，两者最大的区别在于膜法引入了“载体”，微生物在载体上生长繁殖，并形成了膜状生物污泥--生物膜。微生物种类复杂，大量原生生物和细菌生长在生物膜表面，有的成长成不同的微型生物形成有机物，食物链表达为细菌吞噬原生生物留下的形成有机污染物，利用传质作用，有机污染物穿过膜表面和内部，经过代谢活动被降解下来。
生物接触氧化法，也称“悬浮-附着生物接触氧化法”。气、液、固三相混合接触，加之调料的分隔作用，水流状况比较良好，氧利用率高，挂膜比较简单。它的优点是运行稳定操作简单，耐冲击负荷能力强，能耗较低，产生污泥净化功能强具有脱氮功能。缺点
是要保证生物膜不要过厚，否则容易堵塞装置，文护费运用过高。
（2）厌氧生物法：在厌氧菌的作用下需要耗费大量的时间来降解有机物。厌氧微生物繁殖生长及其对有机物质降解处理的过程中不需要任何氧,而且厌氧微生物可适应更高COD浓度的废水（4000-10000mg/L）.厌氧生化处理的缺点是生化处理时间很长,废水在厌氧生化池内的停留时间一般需要40小时以上。普遍运用的厌氧工艺有：上流式厌氧污泥床(UASB)、厌氧复合床(UBF)等。