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大豆肽的发酵生产方法主要有液态发酵法和固态发酵法两种。固态发酵法主要有以下优点①培养基含水量少，易处理②消耗低，设备简易③设备技术简单④产物浓度高。而液态发酵法具有周期短、产量高、占地面积少；便于操作和控制、生产条件稳定、有利于机械化、自动化生产；所得菌体污染小、菌龄一致、培养液中还可提取多种菌体代谢产物、具有较高的经济价值等优点。因此，液态发酵法一直是微生物发酵法生产大豆肽的主要研究方向。
豆粕经过液态发酵后，水溶性很多，除了包括分子量大小不同的氨基酸、多肽类外，还包括豆粕本身还有的无机盐、盐类、糖类等成分，因此豆粕发酵基质是一个混合体系。大豆肽在不同pH、温度、离子强度等条件下都是可溶的，且比未经水解的大豆母体蛋白溶解度有极大的提高。这主要是因为蛋白酶使蛋白质分解，相对分子质量减少，极性基团增加，进而使溶解度增大。用酸碱盐提取可以分别去除一些碱溶、酸溶、和对离子强度有要求的物质，在保证多肽含量的前提下，尽量减少提取液中的杂质。大豆肽提取液通常具有较深的颜色，脱色是大豆肽精制的必要环节，通常采用的脱色方法是用活性炭。
本实验采用液态发酵法比较枯草芽孢杆菌和黑曲霉发酵降解豆粕生产大豆多肽的工艺，通过对不同碳源及其浓度，豆粕浓度，接种量，发酵时间等因素的研究优化发酵工艺条件。