摘要为了更好地明确栽培药用菊花与菊属野生种的亲缘关系,运用ITS序列对栽培药用菊花13个品种和菊属植物12个种之间的遗传关系进行比较分析。利用ITS的通用引物对供试材料进行DNA扩增,运用CodonCode Aligner V3.0软件对测序峰图进行校对拼接,,采用MEGA5.0软件进行序列比对,遗传距离计算及UPGMA聚类树构建,并进行亲缘关系分析。结果发现,栽培药用菊中大部分品种之间亲缘关系较近,而这些栽培药用菊中多数与其他菊属植物间亲缘关系较远。研究栽培药用菊花与其他菊属植物间的亲缘关系有助于栽培药用菊花的保护和种质创新。58259
毕业论文关键词:栽培菊;菊属植物;ITS;亲缘关系
Abstract
To better understand the relationship among wild species and cultivated varieties of Chrysanthemum,we have comparatively analyzed twelve wild species and thirteen cultivars by using ITS PCR technology.We used the primers of ITS to identify the polymorphism and CodonCode Aligner V3.0 software to check stitching sequencing peak figure,then based on the Annotation method of hidden markov model for ITS sequence.Using MEGA5.0 software for sequence alignment. Calculating the genetic distance and building the UPGMA clustering tree and analysing the kinship of wild species and cultivated varieties.Finally,the results presented that, most of the cultivation of medicinal chrysanthemum has close genetic relationship among various varieties,while most other wild varieties and cultivated medicinal chrysanthemum genetic relationship between far away.
Keywords:cultivated Chrysanthemum; wild species; ITS; kinship
目 录
摘 要 2
Abstract 2
目 录 3
综 述 3
引 言 5
1 材料与方法 5
1.1 材料 5
1.1.1 栽培药用菊及菊属野生种材料 5
1.1.2 实验器材 6
1.1.3 实验试剂 7
1.2方法 7
1.2.1 DNA提取 7
1.2.2 PCR扩增、电泳检测及测序 8
1.2.3 序列分析、系统发生树构建 8
2 结果与分析 9
2.1 电泳结果 9
2.2 序列结果 9
2.2.1 栽培药用菊 9
2.2.2 其他菊属植物ITS序列 13
2.3 对栽培菊间及栽培菊与其他菊属植物间ITS遗传变异的差异分析 17
2.3.1遗传相似性分析 17
2.3.2聚类分析 20
3 讨论 21
参考文献 23
致谢 24
综 述菊花(Chrysanthemum morifolium )为菊科(Compositae)菊属(Chrysanthemum L) 的多年生花卉,在花卉界被誉为世界两大花卉育种奇观之一[1]。它是我国的传统名花,经济价值和观赏价值高,形态优雅,文化内涵丰富,广受大众的喜爱。除了具有观赏价值外,很多菊花为常用中药,有散风清热、平肝明目、清热解毒之功效,常用于风热感冒,头痛眩晕,目赤肿痛,眼目昏花[2],我国药用菊花具有悠久的历史,分布广泛,类型多样,根据产地不同,主要有杭菊、贡菊、亳菊、滁菊、怀菊、济菊和祁菊等类型。《补农书》描述“甘菊性甘温,久服最有益”。《神农本草经》将菊列为疏风散热、解毒消肿、利言明目之上品。李时珍在《本草纲目》中道“菊能利五脉,调四肢,治头风热补”。现代医学研究证明:菊中含有挥发油、菊甙、氨基酸、黄酮类及多种维生素和微量元素,对大肠杆菌、福氏痢疾杆菌、金黄色葡萄球菌具有较强的抵制作用,具有止痢、降压、降脂、消炎、明目、强身的作用。