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本研究拟在前人研究基础上，通过厌氧真菌ITS数据深入挖掘，分析草食动物厌氧真菌菌群多态性及组成结构，并在此基础上比较研究反刍动物与非反刍动物厌氧真菌菌群结构差异及瘤胃内容物与粪便中厌氧真菌菌群结构的差异，旨在了解草食动物厌氧真菌菌群特性，为促进草食动物粗纤文降解的研究提供相应的基础数据。
1 材料与方法
1.1 草食动物厌氧真菌ITS序列获取
在NCBI等数据库根据“厌氧真菌”“ITS序列”关键字查找近年相关文章，从中挑选出含有厌氧真菌ITS序列信息及对应的草食动物样品相关信息，并批量下载相关ITS序列和对应的草食动物样品相关信息（克隆库、454、Miseq）。