2)实验步骤:准备实验需要用到的大豆根,研钵,1.5ml Eppendorf管,进口Tip枪头备用。准备1g洗干净的大豆根,置于研钵中研磨,研磨成粉末后可以停止研磨,否则继续研磨。立即将粉末转入1.5ml Eppendorf管,加入1ml Trizol , 12000r/min,离心5分钟。加入200μL氯仿,震荡混匀,室温静置10min。静置后,4℃,12000r/min,离心5分钟。把离心好的上清夜转移到新的Eppendorf管,将异丙醇加入此管(0.6ml),混匀后室温下静置。静置后的液体,4℃,12000r/min,离心10分钟,弃上清,加入1ml 75%的乙醇,温和震荡,悬浮沉淀,8000 r/min,离心5分钟,弃上清。室温晾干,用50μL DEPC处理水、TE缓冲液或0.5%SDS溶解RNA样品,55-60℃ 6min。存于-80℃超低冰箱中保存。
1.2.2 cDNA克隆
cDNA克隆从由DNA互补的反转录合成的基因转录产物开始,接着将重组载体cDNA克隆,重组,筛选,以获得的cDNA的单分子克隆产物的一项分子技术。
1)原理:MRNA从真核生物的组织或细胞中提取的是在cDNA的合成的第一个步骤,接下来利用逆转录产生碱基互补的mRNA第一链为模板来复制第二链,前提是去除mRNA的表达。双链cDNA制备成功后,可插入到质粒中去,该cDNA中不包含内含子的组成和其他调节序列,cDNA是反转录的DNA,通过mRNA。合成的cDNA通过PCR扩增,并克隆到合适的载体。
2)试验步骤:在PCR管中配置下列混合液
Oligo dT Primer(50μM) 1μL
dNTPMixture(10Mm each) 1μL
Total RNA XμL
RNase free dH2O Up to 10μL
在PCR仪上按65℃,5min,进行变性、退火反应,冰上急速冷却。
在上述的PCR管中配置下列反转录反应液,其体系为:
上述急速冷却的反应液 10μL
5×PrimeScript™ Buffer 4μL
RNase Inhibitor(40U/μL) 0.5μL
PrimeScript™RTase 1μL
RNase free dH2O 4.5μL
总体系为20μL,接下来在PCR仪上按42℃,60min;70℃,15min;4℃ 条件进行反转录反应。cDNA产物置于-20℃保存。
在Uniprot蛋白质数据库搜索MYB91,复制蛋白质序列到Primer5上,源^自(751:文,论)文]网[www.751com.cn,再将Primer5上的序列输入到NCBI的基因库中查找大豆的MYB91基因序列信息,进行Blast比较,得到其编码序列。复制编码序列到Primer5,设计与保守区两端相对应的一对引物F 和R,以上述cDNA为模板,以94℃,5min; 94℃,30s,59℃,30s,72℃,2min,30个循环; 72℃,10min为反应条件在进行PCR仪上进行扩增。PCR扩增后,进行琼脂糖凝胶电泳。切下目的片段于1.5ml离心管中做胶回收。回收的DNA片段保存于-20℃。