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第二章 分子设计与结构优化
分子力学又叫力场方法(force field method),通过计算分子的构象和能量,来研究化合物分子的结构状态,已成为结构化学研究的重要方法之一,不仅主要应用于有机化学领域,生物化学、药物设计、配位化学,甚至在
材料
和
物理
领域,得到了广泛的应用。
本章设计了一系列新的大黄素衍生物分子,并采用分子力学方法等方法计算的新化合物的最优化结构。我们使用ISIS Draw 软件构建表2.1的20个新的大黄素衍生物分子的2D结构,利用chem3D软件建分子3D结构,利用GMESS软件的相应模块选取从头计算的HF方法(3-21G)进行进行全优化,得到该类化合物的能量最低优化结构的原子坐标、键长、键角和二面角等结构数据
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